RNA–Protein interactions for RNA: YGL139W

FLC3, Transcript of Putative FAD transporter, similar to Flc1p and Flc2p, yeast

Gene FLC3, Length 2,409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FLC3	YGL139W	BUD3	P25558	1636 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	TRP1	P00912	224 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	RIM2	P38127	377 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	PEP8	P40335	379 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	DSK2	P48510	373 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	SHH4	Q06236	168 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	MSA1	Q08471	629 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	DAD1	Q12248	94 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	TFS1	P14306	219 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YCR050C	P25630	102 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	MPM1	P40364	252 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	AIM25	P47140	327 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	SUN4	P53616	420 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	EAF6	P47128	113 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YBT1	P32386	1661 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	MID2	P36027	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	PAU5	P43575	122 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YKL102C	P34249	101 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	FIP1	P45976	327 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	RIP-Chip
FLC3	YGL139W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	NPC2	Q12408	173 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	SPO13	P23624	291 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	SMP1	P38128	452 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	CPD1	P53314	239 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YKL097C	P34245	136 aa		4.65	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	PAU16	P35994	123 aa		4.65	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	ROT1	Q03691	256 aa		4.65	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.65	□□□□□ -1.66
FLC3	YGL139W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	MRP21	P38175	177 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	RFM1	Q12192	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	KRE1	P17260	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	SHE1	P38200	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YBR292C	P38357	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YJL028W	P47062	111 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	MSB2	P32334	1306 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	HSP10	P38910	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	MED6	P38782	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	MRS4	P23500	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	SPL2	P38839	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	GPI2	P46961	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	BXI1	P48558	297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	ATO3	Q12359	275 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	COX19	Q3E731	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	GPI18	P38211	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YER181C	P40097	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	GAT4	P40569	121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YGL262W	P53054	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	ATG41	Q12048	136 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	ECM29	P38737	1868 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	SEC11	P15367	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	UMP1	P38293	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YGL034C	P53186	121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YGR164W	P53291	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	MCH4	Q08268	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	TIM18	Q08749	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	MIC27	P50945	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	MST27	P53176	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YNL234W	P53857	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	SDS23	P53172	527 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YNR064C	P53750	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	GSC2	P40989	1895 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	LAA1	P39526	2014 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	SWS2	P53937	143 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	IRC25	Q07951	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	SUT2	Q12286	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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