RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	SHH3	Q04487	196 aa		3	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		3	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YCR099C	P25657	155 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YEL073C	P39974	107 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	PIN3	Q06449	215 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	CSI2	Q08054	341 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	AUS1	Q08409	1394 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	MSW1	P04803	379 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YAL064W	P39711	94 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YNL217W	P40152	326 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	FLX1	P40464	311 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YGR026W	P53217	278 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	MRPS16	Q02608	121 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	LTE1	P07866	1435 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	PDR10	P51533	1564 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	CAT8	P39113	1433 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	MET5	P47169	1442 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	FZF1	P32805	299 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YET1	P35723	206 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YKR032W	P36127	104 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	TVP23	P38962	199 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YFR035C	P43608	114 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YPR063C	Q12160	140 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	MED11	Q99278	115 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	COX5B	P00425	151 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YOL162W	P0CF19	215 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	MID2	P36027	376 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	KRE9	P39005	276 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	ATG10	Q07879	167 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	IRC23	Q08416	157 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YHL042W	P38729	150 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YHR130C	P38834	111 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YHP1	Q04116	353 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	FIT1	Q04433	528 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YOR385W	Q08909	290 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	SCS22	Q6Q595	175 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	SCM4	P32564	187 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	CLB6	P32943	380 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YHR180W	P38868	163 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YFR045W	P43617	309 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	ERG25	P53045	309 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YOR268C	Q08734	132 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YSP2	Q06681	1438 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YIL059C	P40520	121 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	KNH1	P50112	268 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	DOC1	P53068	250 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YNR077C	P53758	84 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	GRX5	Q02784	150 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	QCR10	P37299	77 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	ATP19	P81451	68 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	UPS3	Q04006	179 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	SOM1	Q05676	74 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	LYS2	P07702	1392 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	UBC4	P15731	148 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	ECM31	P38122	312 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	SPO73	P40031	143 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	PIR1	Q03178	341 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	RAF1	Q06891	181 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YDL241W	Q07738	123 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	RAD28	Q12021	506 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		2.9	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		2.9	□□□□□ -1.94
SLX8	YER116C	YEL067C	P39978	195 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	PIR5	P46999	287 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	MAK31	P23059	88 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	MIG1	P27705	504 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YKL044W	P36092	106 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	IPT1	P38954	527 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	SNF11	P38956	169 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	SWC7	Q06707	132 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	IRC19	Q07843	230 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	ATG41	Q12048	136 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YOR015W	Q12169	119 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SLX8	YER116C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.89	□□□□□ -1.95

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