RNA–Protein interactions for RNA: YER086W

ILV1, Transcript of Threonine deaminase, catalyzes first step in isoleucine biosynthesis, yeast

Gene ILV1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ILV1	YER086W	CDC7	P06243	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	RPB9	P27999	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	POP5	P28005	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	UIP3	P39547	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	DSK2	P48510	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	AVT5	P38176	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	RRT1	P38192	103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	CYB5	P40312	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	PAU15	P40585	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	VMA21	P41806	77 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	DAN1	P47178	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	HST4	P53688	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	SDH7	Q04401	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	SDH4	P37298	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	ATG27	P46989	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	YGR219W	P53307	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	LOA1	Q06508	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	INO2	P26798	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	SFT2	P38166	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	GPI2	P46961	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	MGA1	P53050	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	COQ3	P27680	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	IMP2	P46972	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	MOG1	P47123	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	YDL186W	P48568	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	MRX11	Q03079	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	YML122C	Q03207	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	IZH1	Q03419	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	LDS2	Q08218	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	IRC23	Q08416	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	FIT2	Q08906	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	AYT1	Q12226	474 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	YCL042W	P25572	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	SRP21	P32342	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	HSP10	P38910	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	GTT1	P40582	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	SRL1	Q08673	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	TIM18	Q08749	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
ILV1	YER086W	ATP16	Q12165	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	YOP1	Q12402	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	YKL075C	P36083	450 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	MIC12	P38341	106 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	YHR173C	P38864	112 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	MBB1	P39534	108 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	GLE2	P40066	365 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	YER188W	P40103	239 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	ATX2	Q12067	313 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	CYC3	P06182	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	POP7	P38291	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	NSE4	P43124	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	SPG4	Q04438	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	MRS1	P07266	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	YNL194C	P40169	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	IZH3	Q07959	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	POF1	P25576	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	SRP14	P38985	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	ERG28	P40030	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	YIL163C	P40448	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	POR2	P40478	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	VPS55	P47111	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	CPD1	P53314	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	DAD3	P69850	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	ATP19	P81451	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	YBR013C	P38215	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	AIM24	P47127	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	YGR026W	P53217	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	APS2	Q00381	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	RAV2	Q03956	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	HOR7	Q05827	59 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ILV1	YER086W	CCW14	O13547	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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