RNA–Protein interactions for RNA: YBR169C

SSE2, Transcript of Member of the heat shock protein 70 (HSP70) family, yeast

Gene SSE2, Length 2,082 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSE2	YBR169C	YGR039W	P53225	103 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SSE2	YBR169C	YGR219W	P53307	113 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SSE2	YBR169C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SSE2	YBR169C	MSI1	P13712	422 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	VMA11	P32842	164 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YKL102C	P34249	101 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	CWP2	P43497	92 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YFR045W	P43617	309 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	INP1	Q03694	420 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YPL278C	Q08990	100 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	JID1	Q12350	301 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	SPO24	Q3E752	67 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	HFA1	P32874	2273 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	RPL43B	P0CX26	92 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	TRX3	P25372	127 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	ATX1	P38636	73 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	CIS3	P47001	227 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YLR152C	P54072	576 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	EST3	Q03096	181 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	SDC1	Q03323	175 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	UPS1	Q05776	175 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	KEI1	Q06346	221 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	NAT3	Q06504	195 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YDR029W	Q12111	104 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	PEX11	Q12462	236 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	BOL1	Q3E793	110 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	KTI11	Q3E840	82 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	PAU5	P43575	122 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	SFT1	P43682	97 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	OST2	P46964	130 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	AIM25	P47140	327 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	SWS2	P53937	143 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	MRX11	Q03079	207 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YMR166C	Q03829	368 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	DGA1	Q08650	418 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	IZH2	Q12442	317 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YOR338W	Q99326	363 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	SRP21	P32342	167 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	PAU16	P35994	123 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	PEX22	P39718	180 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YJL213W	P40896	331 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	GEP7	P53171	287 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	PRM8	P53174	237 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YOL024W	Q08172	172 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	FIT3	Q08907	204 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	FCY1	Q12178	158 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	COX19	Q3E731	98 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	ECM12	O13529	151 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	MRPS5	P33759	307 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	SDS24	P38314	527 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YEA4	P40004	342 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YGL260W	P53056	76 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	EMC4	P53073	190 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	CAB4	P53332	305 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	PGA1	P53896	198 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YPL039W	Q03080	316 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YMR181C	Q03231	154 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YMR103C	Q04436	120 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YPL264C	Q08980	353 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	ATG41	Q12048	136 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	KRE1	P17260	313 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	MKK1	P32490	508 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	SPO73	P40031	143 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	EGT2	P42835	1041 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	MHF2	Q3E829	80 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	COX5A	P00424	153 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	AGA1	P32323	725 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	YBR063C	P38083	404 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SSE2	YBR169C	ECM14	P38836	430 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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