RNA–Protein interactions for RNA: YBR167C

POP7, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP7, Length 423 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP7	YBR167C	MRS4	P23500	304 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP7	YBR167C	YGL193C	P53097	103 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP7	YBR167C	ORM1	P53224	222 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP7	YBR167C	SEN15	Q04675	128 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP7	YBR167C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	YJL009W	P47078	108 aa		0.27	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	IRC19	Q07843	230 aa		0.27	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	RIB3	Q99258	208 aa		0.27	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	FES1	P38260	290 aa		0.26	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		0.25	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	YDR476C	Q03362	224 aa		0.25	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	YPR153W	Q06537	140 aa		0.25	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	GPI11	Q06636	219 aa		0.25	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	RFU1	Q08003	200 aa		0.25	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	YHR140W	P38842	239 aa		0.24	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	MAK3	Q03503	176 aa		0.24	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	SRP21	P32342	167 aa		0.23	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	DLS1	P40366	167 aa		0.23	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	FIP1	P45976	327 aa		0.23	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	IRC21	Q04772	201 aa		0.23	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	RDI1	Q12434	202 aa		0.23	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	YER121W	P40076	114 aa		0.22	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	GIM5	Q04493	163 aa		0.22	□□□□□ -2.37
POP7	YBR167C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	SRL3	P36167	246 aa		0.21	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	DIE2	P50076	525 aa		0.21	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	ATP19	P81451	68 aa		0.21	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	YPR202W	Q08993	238 aa		0.21	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	YLR053C	Q12026	108 aa		0.21	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		0.2	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	PEX34	P25584	144 aa		0.2	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	VPS51	P36116	164 aa		0.2	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	GPI2	P46961	280 aa		0.2	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	RRT7	Q07829	113 aa		0.2	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	APQ12	P40532	138 aa		0.19	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	EST3	Q03096	181 aa		0.19	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	YPD1	Q07688	167 aa		0.19	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.19	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	PHO13	P19881	312 aa		0.18	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	SLM6	P38343	150 aa		0.18	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	COA6	Q3E846	104 aa		0.17	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	YER181C	P40097	107 aa		0.16	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	MVB12	P42939	101 aa		0.16	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	YMR122C	Q03879	124 aa		0.16	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	HUT1	Q12520	339 aa		0.16	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.16	□□□□□ -2.38
POP7	YBR167C	MHF1	Q3E835	90 aa		0.15	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		0.15	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	COX5B	P00425	151 aa		0.14	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	FIT3	Q08907	204 aa		0.13	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.13	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	CHD1	P32657	1468 aa		0.13	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	QCR2	P07257	368 aa		0.12	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	LST8	P41318	303 aa		0.12	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	YMR321C	Q04898	105 aa		0.12	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	YNL019C	P53975	284 aa		0.1	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	KTI11	Q3E840	82 aa		0.1	□□□□□ -2.39
POP7	YBR167C	FYV5	P25585	152 aa		0.09	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	COA4	Q05809	96 aa		0.09	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	SAC3	P46674	1301 aa		0.09	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	UBR1	P19812	1950 aa		0.08	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.07	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	NMT1	P14743	455 aa		0.07	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	AME1	P38313	324 aa		0.07	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	YCL001W-A	P87012	153 aa		0.07	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	ANB1	P19211	157 aa		0.06	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	0.06	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	NSL1	Q12143	216 aa		0.05	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	LAA1	P39526	2014 aa		0.04	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	FUN14	P18411	198 aa		0.04	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	DER1	P38307	211 aa		0.04	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	EMC4	P53073	190 aa		0.04	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	SOM1	Q05676	74 aa		0.04	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	PHB1	P40961	287 aa		0.03	□□□□□ -2.4
POP7	YBR167C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
POP7	YBR167C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
POP7	YBR167C	YBR013C	P38215	129 aa		0.02	□□□□□ -2.41
POP7	YBR167C	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
POP7	YBR167C	RAF1	Q06891	181 aa		0.02	□□□□□ -2.41
POP7	YBR167C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
POP7	YBR167C	MIC27	P50945	234 aa		0.01	□□□□□ -2.41
POP7	YBR167C	NAT5	Q08689	176 aa		0.01	□□□□□ -2.41
POP7	YBR167C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
POP7	YBR167C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	0	□□□□□ -2.41
POP7	YBR167C	SFT2	P38166	215 aa		-0.01	□□□□□ -2.41

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