RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P PRE9P23638 258 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC50P25656 391 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P SFT2P38166 215 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P SLM6P38343 150 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YEA6P39953 335 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P PRE5P40302 234 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR269WP40326 108 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P RPR2P40571 144 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P MCM22P47167 239 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P IZH1Q03419 316 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR007WQ03675 126 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR244WQ04018 355 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P ERP1Q05359 219 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR195CQ06594 109 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P IZH3Q07959 543 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P ERV2Q12284 196 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P SCM3Q12334 223 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P PUT1P09368 476 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P SAR1P20606 190 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P SPO13P23624 291 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS2P25443 254 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P FPR2P32472 135 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P DER1P38307 211 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P MBB1P39534 108 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL13BP40212 199 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P GAT4P40569 121 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P IMP2P46972 177 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P PNC1P53184 216 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P HST4P53688 370 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P BOR1P53838 576 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P SGF11Q03067 99 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P MRPS8Q03799 155 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR082CQ04276 118 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P LOA1Q06508 300 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P BER1Q06688 274 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P PRR2Q12310 699 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR213W-AQ8TGT4 77 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YOL085CQ99345 113 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P DDI2P0CH63 225 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P DDI3P0CH64 225 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P ACB1P31787 87 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YPC1P38298 316 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P BOL3P39724 118 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YEA4P40004 342 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P SWM2P40342 146 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P TAD2P47058 250 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P AIM24P47127 394 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YNR071CP53757 342 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data1.91□□□□□ -2.1not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P FMP41P53889 259 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL242WQ07746 117 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P VAM10Q08474 114 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR145C-AQ2V2P0 78 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P RPB3P16370 318 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P MAG1P22134 296 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P NPL6P32832 435 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P AFR1P33304 620 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P YBL059WP34224 193 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P SAP30P38429 201 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P PET100P38958 111 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX7P39108 375 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P VHS2P40463 436 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P SNX4P47057 423 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P DSK2P48510 373 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL117WP53133 265 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P TOM7P53507 60 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P AVO2Q04749 426 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL162CQ12042 273 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL194C-AQ2V2P6 80 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P HTB2P02294 131 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P Q0255P03881 472 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P MRP2P10663 115 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P CKS1P20486 150 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P HSP12P22943 109 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P EMP24P32803 203 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL015CP33199 130 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P TRS20P38334 175 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR022CP38763 256 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P SAS2P40963 338 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC40P40968 455 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P JAC1P53193 184 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P ORM1P53224 222 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P YNR066CP53752 436 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P MRPS16Q02608 121 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P ADD37Q03233 198 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P TMA23Q03525 211 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P ATC1Q04005 294 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P SDO1Q07953 250 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P FIT2Q08906 153 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR063CQ12160 140 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR015WQ12169 119 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)PtW(CCA)P TMA17Q12513 150 aa1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.5 ms