RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B COX10P21592 462 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPL25P23369 157 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B EMP24P32803 203 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B SEC66P33754 206 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B YUH1P35127 236 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B YBR137WP38276 179 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B RPF1P38805 295 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B YHR173CP38864 112 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B CWP2P43497 92 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B KEG1P43614 200 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B DIE2P50076 525 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B PHO23P50947 330 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B CUS2P53830 285 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B AIM34Q03673 198 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B SDH7Q04401 133 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR224WQ05947 369 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B GGA1Q06336 557 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B TIM22Q12328 207 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)BtF(GAA)B RFA3P26755 122 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B QRI5P32344 111 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B SCM4P32564 187 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B FMT1P32785 401 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B SNC2P33328 115 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B MIX23P38162 196 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B RRF1P38771 230 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B RPC10P40422 70 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YIL163CP40448 117 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data0.15□□□□□ -2.39not detected
tF(GAA)BtF(GAA)B INA22P40576 216 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B HYR1P40581 163 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YJL144WP47009 104 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B OST3P48439 350 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B UBC11P52492 156 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR018CP53211 109 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR042WP53227 271 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS75P53853 264 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B PGA1P53896 198 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YNL019CP53975 284 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B PMP3P87284 55 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B DCS1Q06151 350 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG17Q06410 417 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B ARR3Q06598 404 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR053CQ12026 108 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B NFI1Q12216 726 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG31Q12421 196 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR145C-AQ2V2P0 78 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B THP2O13539 261 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B ADH3P07246 375 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YGL041W-AP0C5N3 154 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YER039C-AP0CD97 72 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B SEC59P20048 519 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YCR022CP25620 114 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B VMA8P32610 256 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B VAM7P32912 316 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YBR016WP38216 128 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B UMP1P38293 148 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B SIC1P38634 284 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B MTW1P39731 289 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B THO1P40040 218 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B MPM1P40364 252 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YRB2P40517 327 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B TFG2P41896 400 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YJR111CP47148 283 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YGL193CP53097 103 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B BRP1P53194 125 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B FMP48P53233 369 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B HST4P53688 370 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B SPR6Q01684 191 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B SHR3Q02774 210 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B ADD37Q03233 198 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YMD8Q03697 442 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B TY1A-MR1Q04215 440 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B RAD33Q04231 177 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B ELP6Q04868 273 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B ORM2Q06144 216 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B TSR2Q06672 205 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG41Q12048 136 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B RDI1Q12434 202 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YGL258W-AQ3E740 77 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B LSO1Q3E827 93 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B Q0032Q9ZZX7 96 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B MATALPHA1P0CY06 175 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B HMLALPHA1P0CY07 175 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B CPR1P14832 162 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B URA6P15700 204 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B CCA1P21269 546 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B YCR023CP25351 611 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B VMA5P31412 392 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B ERG24P32462 438 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B ZRT1P32804 376 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B PRS1P32895 427 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B DUT1P33317 147 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B SHB17P36136 271 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B LAS1P36146 502 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data0.13□□□□□ -2.39not detected
tF(GAA)BtF(GAA)B YFR045WP43617 309 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)BtF(GAA)B DAN1P47178 298 aa0.13□□□□□ -2.39
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