RNA–Protein interactions for RNA: YPR119W

CLB2, Transcript of B-type cyclin involved in cell cycle progression, yeast

Gene CLB2, Length 1,476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cellular bud .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLB2	YPR119W	USV1	Q12132	391 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	GEP5	Q12393	293 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	RPL12B	P0CX54	165 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YGR050C	P53231	118 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YNR048W	P53740	393 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YNL184C	P53876	108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	DPP1	Q05521	289 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	IRC13	Q08630	104 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	MRS1	P07266	363 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	ATP10	P18496	279 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	DOG2	P38773	246 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	ATF1	P40353	525 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	HNT2	P49775	206 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	AQR1	P53943	586 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	VPS71	Q03433	280 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	BET5	Q03630	159 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YHM2	Q04013	314 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YFH1	Q07540	174 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	SOR2	Q07786	357 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	DUT1	P33317	147 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	CMC1	P36064	111 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YFL054C	P43549	646 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	DSK2	P48510	373 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	DMA2	P53924	522 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YLR460C	P54007	376 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YOR292C	Q08743	309 aa		5	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	SAG1	P20840	650 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	PCL1	P24867	279 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	SWD3	P38123	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	UBS1	P38290	277 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
CLB2	YPR119W	YAR068W	P39564	161 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	OSW5	P40219	148 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YJL163C	P46996	555 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YNR071C	P53757	342 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	FIT3	Q08907	204 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	INO4	P13902	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	SAS2	P40963	338 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	SHR5	P41912	237 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	SDS23	P53172	527 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	BRP1	P53194	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	WSC2	P53832	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YNL092W	P53934	400 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	OPI10	Q08202	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YLR302C	O13544	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	HEM4	P06174	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	SRX1	P36077	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YBR090C	P38253	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	ICS2	P38284	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	ATX1	P38636	73 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	PCL7	P40186	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	SPG5	P42933	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	DIC1	Q06143	298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	HNT3	Q08702	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	PRM3	Q08931	133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	POM34	Q12445	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLB2	YPR119W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	ECM14	P38836	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YJR096W	P47137	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	CRZ1	P53968	678 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	ATP19	P81451	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YPS3	Q12303	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	HSP150	P32478	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YPT10	P38146	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 81.1 ms