RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	ATP23	P53722	227 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YHM2	Q04013	314 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RFU1	Q08003	200 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ECM12	O13529	151 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ELO2	P25358	347 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YIL024C	P40543	189 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YDR042C	Q03205	200 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	PBA1	Q05778	276 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	IRC13	Q08630	104 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YDR029W	Q12111	104 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MCT1	Q12283	360 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YPR071W	Q12346	211 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPB10	P22139	70 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	UGX2	P32772	223 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YKL069W	P36088	180 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	CWP2	P43497	92 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	DIC1	Q06143	298 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MIM1	Q08176	113 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YPL261C	Q08976	102 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPB8	P20436	146 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MDH2	P22133	377 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	SRX1	P36077	127 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	TEM1	P38987	245 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YER134C	P40081	178 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	VHS2	P40463	436 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	DAD4	P69851	72 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	CCH1	P50077	2039 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ERG2	P32352	222 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MCH2	P36032	473 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	UTH1	P36135	365 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ATF1	P40353	525 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	SWS2	P53937	143 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MIX14	Q04341	121 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YDL180W	Q12301	547 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ERG4	P25340	473 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YKL044W	P36092	106 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	INN1	P53901	409 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	OCA2	P53949	197 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	EST3	Q03096	181 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	IZH1	Q03419	316 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YKR041W	P36134	250 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YFL065C	P43539	102 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	VPS55	P47111	140 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YPL278C	Q08990	100 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YPR203W	Q08994	102 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	PFA4	Q12006	378 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YPR015C	Q12531	247 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	HMRA2	P0CY13	119 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	PHS1	P40857	217 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	UBC11	P52492	156 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	PET191	Q02772	108 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	TRS23	Q03784	219 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	SHH3	Q04487	196 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	FIT3	Q08907	204 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	KTI11	Q3E840	82 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	PAM16	P42949	149 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YMR181C	Q03231	154 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	ARR3	Q06598	404 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	LDS2	Q08218	356 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YJL213W	P40896	331 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YHR140W	P38842	239 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YFR020W	P43600	232 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	HSK3	P69852	69 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	SET6	Q12529	373 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	CDC43	P18898	376 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YHR173C	P38864	112 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	CUP9	P41817	306 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	NCA3	P46955	337 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YOR387C	Q08910	206 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	PST1	Q12355	444 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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