RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	HHO1	P53551	258 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	TSA2	Q04120	196 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	DGK1	Q12382	290 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	REP2	P03872	296 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	PHO85	P17157	305 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	TFC1	P32367	649 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RCN1	P36054	211 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	MSA2	P36157	363 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	OST2	P46964	130 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	SOL1	P50278	321 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RUB1	Q03919	77 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	MCP1	Q12106	302 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	PSF1	Q12488	208 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	SGA1	P08019	549 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YLR156W	P0CE96	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YLR159W	P0CE97	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YLR161W	P0CE98	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	NMT1	P14743	455 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	HSP30	P25619	332 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	ECM34	P38728	170 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RRT13	P40042	185 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	SER2	P42941	309 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YFR054C	P43622	192 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	CAX4	P53223	239 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	FMN1	Q03778	218 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	GEP5	Q12393	293 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RPB9	P27999	122 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YER134C	P40081	178 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	PGD1	P40356	397 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	STT4	P37297	1900 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	VMA11	P32842	164 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YER181C	P40097	107 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YGR017W	P53210	297 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	CAB4	P53332	305 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	APJ1	P53940	528 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	ATG39	Q06159	398 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	FYV7	Q12247	151 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	HFA1	P32874	2273 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	ATP5	P09457	212 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	ATP15	P21306	62 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	UGX2	P32772	223 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	PTC1	P35182	281 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	IES3	Q12345	250 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	ODC2	Q99297	307 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	UTH1	P36135	365 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	SWD3	P38123	315 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	CSH1	P38287	376 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	AYR1	P40471	297 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	3.33	□□□□□ -1.88	not detected
RPS1B	YML063W	FIP1	P45976	327 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	PGU1	P47180	361 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	YOR214C	Q12282	236 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	SRX1	P36077	127 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	YFL019C	P43576	117 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	DSK2	P48510	373 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	EMC4	P53073	190 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	YGR026W	P53217	278 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	PIR1	Q03178	341 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	RSM10	Q03201	203 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	VPS71	Q03433	280 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	NAT3	Q06504	195 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	LDB18	Q07887	179 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	FCY1	Q12178	158 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS1B	YML063W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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