RNA–Protein interactions for RNA: YLR089C

ALT1, Transcript of Alanine transaminase (glutamic pyruvic transaminase), yeast

Gene ALT1, Length 1,779 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ALT1	YLR089C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	TFS1	P14306	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YCR102C	P25608	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	ECM15	P35195	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	PAU15	P40585	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	LCB3	P47013	409 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SBH1	P52870	82 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	XBP1	P40489	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	BRR6	P53062	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	AVO2	Q04749	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	HEM25	Q07534	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	PRM3	Q08931	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	RLM1	Q12224	676 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	RAD6	P06104	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	COX10	P21592	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YCR007C	P25354	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	IES6	P32617	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	ZRT1	P32804	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YKR073C	P36153	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	DUG3	P53871	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	ENB1	Q08299	606 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	IRA2	P19158	3079 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YCR100C	P25606	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SPS18	P32572	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	GPX1	P36014	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	RTC2	P38279	296 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	OM14	P38325	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	GON7	P46984	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YGR149W	P48236	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	HSK3	P69852	69 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SIR2	P06700	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	CHO1	P08456	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	HSP150	P32478	413 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	TIM12	P32830	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	YHR180W	P38868	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	TEM1	P38987	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	DLS1	P40366	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	CAT5	P41735	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	PAM16	P42949	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	FIT1	Q04433	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	KTI11	Q3E840	82 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	YBR144C	P34215	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	HMS2	P47175	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	UPS1	Q05776	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	CTR3	Q06686	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	SPO24	Q3E752	67 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	CSF1	Q12150	2958 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	CNE1	P27825	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	ECO1	P43605	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	VHT1	P53241	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	MRX11	Q03079	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	NAT3	Q06504	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	YNL198C	P40166	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	YFR045W	P43617	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	UBX6	P47049	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	TTI2	P47168	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	PGU1	P47180	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	YGR039W	P53225	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	PDR17	P53844	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	YLR152C	P54072	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	SDC1	Q03323	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	MSS11	Q03825	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	VBA1	Q04301	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	MIX14	Q04341	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	ELP6	Q04868	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	IRC19	Q07843	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	PAU19	P0CE85	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ALT1	YLR089C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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