RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	MDM10	P18409	493 aa		2.47	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	PEX7	P39108	375 aa		2.47	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	YNR066C	P53752	436 aa		2.47	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	CDC7	P06243	507 aa		2.46	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	MLF3	P32047	452 aa		2.46	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	MIX23	P38162	196 aa		2.46	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	DER1	P38307	211 aa		2.46	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	YNR071C	P53757	342 aa		2.46	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	POM34	Q12445	299 aa		2.46	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.46	□□□□□ -2.01
STE6	YKL209C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	CYC3	P06182	269 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	SFT2	P38166	215 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	SDH8	P38345	138 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	NIF3	P53081	288 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YGR017W	P53210	297 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	IZH1	Q03419	316 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	DXO1	Q06349	442 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YLR358C	O13565	187 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	UTR5	P32630	166 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	POP2	P39008	433 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	PRM5	P40476	318 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	CTR3	Q06686	241 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	CSM4	Q08955	156 aa		2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YKL162C	P36052	402 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YPC1	P38298	316 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YDL183C	P48569	320 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	MRPL50	P53724	139 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YLR224W	Q05947	369 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	TIM18	Q08749	192 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	NRG2	P38082	220 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	GOS1	P38736	223 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	DFG10	P40526	253 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YGR050C	P53231	118 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	CAF40	P53829	373 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	SHH3	Q04487	196 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	ENV7	Q12003	364 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	ARG80	P07249	177 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	RPR2	P40571	144 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	DIE2	P50076	525 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	TOM7	P53507	60 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	SCW10	Q04951	389 aa		2.45	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	ISU1	Q03020	165 aa		2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	ATG39	Q06159	398 aa		2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YLR302C	O13544	120 aa		2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YOR015W	Q12169	119 aa		2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	MRPL33	P20084	86 aa		2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	MIC12	P38341	106 aa		2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	VMA7	P39111	118 aa		2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	MBB1	P39534	108 aa		2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	SPC1	P46965	94 aa		2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	CRC1	Q12289	327 aa		2.44	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	HTB2	P02294	131 aa		2.43	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	FMT1	P32785	401 aa		2.43	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	2.43	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	FLO5	P38894	1075 aa		2.43	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YNL194C	P40169	301 aa		2.43	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	TVP18	Q04767	167 aa		2.43	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	FRQ1	Q06389	190 aa		2.43	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YGR149W	P48236	432 aa		2.43	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	MIC26	P50087	233 aa		2.43	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.43	□□□□□ -2.02	not detected
STE6	YKL209C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	DAD4	P69851	72 aa		2.43	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	2.43	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	GAT4	P40569	121 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YJL028W	P47062	111 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	MGA1	P53050	456 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YOR105W	Q08504	108 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YPR063C	Q12160	140 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	CPR4	P25334	318 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	CDC50	P25656	391 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	IRC22	P40006	225 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	HUA1	P40325	198 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	DAD3	P69850	94 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	BOL1	Q3E793	110 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	POF1	P25576	258 aa		2.42	□□□□□ -2.02
STE6	YKL209C	YKR045C	P36138	183 aa		2.42	□□□□□ -2.02

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