RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	IKI1	P38874	309 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	OXA1	P39952	402 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	VHS2	P40463	436 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	HRD1	Q08109	551 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.81	□□□□□ -2.28	not detected
TTI1	YKL033W	SRY1	P36007	326 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	GLE2	P40066	365 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	CAT5	P41735	233 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	OTU1	P43558	301 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SNO1	Q03144	224 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YOL160W	Q08321	113 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	CCW12	Q12127	133 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	HIS3	P06633	220 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	URA6	P15700	204 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YGR018C	P53211	109 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	FYV6	P53913	173 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YNG1	Q08465	219 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	PEX27	Q08580	376 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YPR063C	Q12160	140 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	VPS63	O13549	108 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	ARG80	P07249	177 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	GCN3	P14741	305 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	ZRC1	P20107	442 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	PAU2	P32612	120 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	POP8	P38208	133 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	VMA22	P38784	181 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	BDH1	P39714	382 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	BET5	Q03630	159 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	ATG41	Q12048	136 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	FAR1	P21268	830 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YDR010C	Q12426	110 aa		0.8	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	PET54	P10834	293 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SEC66	P33754	206 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.79	□□□□□ -2.28	not detected
TTI1	YKL033W	YPC1	P38298	316 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	MSS2	P40990	351 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YFR057W	P43625	151 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	GPI2	P46961	280 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	IMP2	P46972	177 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SGF11	Q03067	99 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YOR385W	Q08909	290 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YPL162C	Q12042	273 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	FCY2	P17064	533 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YCR025C	P25352	136 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	FMT1	P32785	401 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	FMP23	P38231	175 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	TRS20	P38334	175 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	JLP2	P40206	208 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	POG1	P40473	351 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SAS2	P40963	338 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YJR015W	P47090	510 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	NIF3	P53081	288 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	MRPS8	Q03799	155 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	MGR3	Q04472	501 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YLR194C	Q05777	254 aa		0.79	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	CMC1	P36064	111 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RRT1	P38192	103 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	NVJ1	P38881	321 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.78	□□□□□ -2.28	not detected
TTI1	YKL033W	HPA3	P39979	161 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	POR2	P40478	281 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SNX4	P47057	423 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	MCM22	P47167	239 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	MEH1	Q02205	184 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	VPS28	Q02767	242 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	EST3	Q03096	181 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SPC24	Q04477	213 aa		0.78	□□□□□ -2.28

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