RNA–Protein interactions for RNA: YHR106W

TRR2, Transcript of Mitochondrial thioredoxin reductase, yeast

Gene TRR2, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRR2	YHR106W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	YBL059W	P34224	193 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	PET100	P38958	111 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	SIM1	P40472	476 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	SRB7	P47822	140 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	YGL117W	P53133	265 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	YNR066C	P53752	436 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	UBC7	Q02159	165 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	ODC1	Q03028	310 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRR2	YHR106W	CYC7	P00045	113 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	AHT1	P29589	182 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	MLF3	P32047	452 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.39	□□□□□ -1.55	not detected
TRR2	YHR106W	CMC1	P36064	111 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YBR292C	P38357	123 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	MST28	P39552	234 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	TAD2	P47058	250 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	MST27	P53176	234 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YNR071C	P53757	342 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	ARR3	Q06598	404 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YDL242W	Q07746	117 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YPR063C	Q12160	140 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	DDI2	P0CH63	225 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	DDI3	P0CH64	225 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	GCN3	P14741	305 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	ATG27	P46989	271 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	CAF40	P53829	373 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	COX12	Q01519	83 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	ISU1	Q03020	165 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	GEP3	Q08622	556 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	DER1	P38307	211 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	PTC7	P38797	343 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YIP3	P53633	176 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	IZH1	Q03419	316 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	CTR3	Q06686	241 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.36	□□□□□ -1.55	not detected
TRR2	YHR106W	ZRC1	P20107	442 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	MRPL50	P53724	139 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	MRX11	Q03079	207 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	ATC1	Q04005	294 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	AVO2	Q04749	426 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	ATX2	Q12067	313 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	PHD1	P36093	366 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YIL077C	P40508	320 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YFR035C	P43608	114 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	LCB3	P47013	409 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YMR007W	Q03675	126 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	MRPS8	Q03799	155 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YMR244W	Q04018	355 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	LOA1	Q06508	300 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YOL160W	Q08321	113 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	CDC50	P25656	391 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	TIR2	P33890	251 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	NRG2	P38082	220 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	CCW12	Q12127	133 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	PRM7	Q12459	698 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TRR2	YHR106W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	SPO13	P23624	291 aa		5.33	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	SPC25	P40014	221 aa		5.33	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	STP4	Q07351	490 aa		5.33	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	SHG1	P38337	142 aa		5.32	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	YCL001W-A	P87012	153 aa		5.32	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	FIT2	Q08906	153 aa		5.32	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	MRS1	P07266	363 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	VMA22	P38784	181 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	SNX4	P47057	423 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	YJR096W	P47137	282 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	MCM22	P47167	239 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	DSK2	P48510	373 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	GNP1	P48813	663 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	ISU2	Q12056	156 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	YLR125W	Q12138	136 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	MBB1	P39534	108 aa		5.3	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	MIG3	P39943	394 aa		5.3	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	YER135C	P40082	130 aa		5.3	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	SPI1	P40092	148 aa		5.3	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
TRR2	YHR106W	JAC1	P53193	184 aa		5.3	□□□□□ -1.56

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