RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W PHD1P36093 366 aa6.52□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W AIM24P47127 394 aa6.52□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W SCM3Q12334 223 aa6.52□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W POM34Q12445 299 aa6.52□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W YMR316C-AI2HB70 103 aa6.51□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W AFR1P33304 620 aa6.51□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W SFT2P38166 215 aa6.51□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W SLM6P38343 150 aa6.51□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W GPI15P53961 229 aa6.51□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W PUT1P09368 476 aa6.5□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W YIL077CP40508 320 aa6.5□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W ATG27P46989 271 aa6.5□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W MIC27P50945 234 aa6.5□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W FMP41P53889 259 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W TMA17Q12513 150 aa6.5□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W YCR025CP25352 136 aa6.49□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W TIR2P33890 251 aa6.49□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W SHB17P36136 271 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W BOR1P53838 576 aa6.49□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W VMA16P23968 213 aa6.48□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W PPQ1P32945 549 aa6.48□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W SWM2P40342 146 aa6.48□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa6.48□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W PTC7P38797 343 aa6.47□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W SAS2P40963 338 aa6.47□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W PKP2P53170 491 aa6.47□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W YNR071CP53757 342 aa6.47□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W TIM44Q01852 431 aa6.47□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W ISU1Q03020 165 aa6.47□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W SHH3Q04487 196 aa6.47□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W YCR075W-AQ3E830 75 aa6.47□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W ISN1Q99312 450 aa6.47□□□□□ -1.37
CPD1YGR247W SAL1D6W196 494 aa6.46□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W DDI2P0CH63 225 aa6.46□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W DDI3P0CH64 225 aa6.46□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W LSM2P38203 95 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YBR242WP38331 238 aa6.46□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W PET100P38958 111 aa6.46□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W PRE5P40302 234 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YGR269WP40326 108 aa6.46□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W RRT7Q07829 113 aa6.46□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W ENV7Q12003 364 aa6.46□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W CCW12Q12127 133 aa6.46□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa6.46□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YEA6P39953 335 aa6.45□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W GNP1P48813 663 aa6.45□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W ERP1Q05359 219 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YPR195CQ06594 109 aa6.45□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W ARR3Q06598 404 aa6.45□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W ERV2Q12284 196 aa6.45□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa6.45□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YKE4P40544 346 aa6.44□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YMR082CQ04276 118 aa6.44□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W TAL1P15019 335 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YHR022CP38763 256 aa6.43□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W VHS2P40463 436 aa6.43□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W PRR2Q12310 699 aa6.43□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa6.43□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W EMP24P32803 203 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YDR157WA0A023PZE8 133 aa6.41□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W YJR096WP47137 282 aa6.41□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W MRPS16Q02608 121 aa6.41□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W SNO1Q03144 224 aa6.41□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W NPL6P32832 435 aa6.4□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W MBB1P39534 108 aa6.4□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W CTR3Q06686 241 aa6.4□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W BER1Q06688 274 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CPD1YGR247W DID2P69771 204 aa6.39□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W RPB3P16370 318 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W DER1P38307 211 aa6.38□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W IRC22P40006 225 aa6.38□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W PNC1P53184 216 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W CRC1Q12289 327 aa6.38□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W GCN3P14741 305 aa6.37□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W ANB1P19211 157 aa6.37□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W YBL059WP34224 193 aa6.37□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W MRPL4P36517 319 aa6.37□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W TMA23Q03525 211 aa6.37□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W YMR007WQ03675 126 aa6.37□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W SIT1P39980 628 aa6.36□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W YEA4P40004 342 aa6.36□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W YPS5P53057 165 aa6.36□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W MRX11Q03079 207 aa6.36□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W YDL242WQ07746 117 aa6.36□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W YOL085CQ99345 113 aa6.36□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W QCR9P22289 66 aa6.35□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W PEX7P39108 375 aa6.35□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W SPC1P46965 94 aa6.35□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W ATX2Q12067 313 aa6.35□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W YGR240C-AQ3E786 66 aa6.35□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W VAR1P02381 398 aa6.34□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W HSP12P22943 109 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W LCL2Q08045 131 aa6.34□□□□□ -1.39
CPD1YGR247W ELF1P36053 145 aa6.33□□□□□ -1.4
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