RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	DCS1	Q06151	350 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	FPR2	P32472	135 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	ERV15	P38312	142 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	IRC22	P40006	225 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	LST7	P53237	242 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	QCR2	P07257	368 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	PCL2	P25693	308 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	GOS1	P38736	223 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	YHR122W	P38829	231 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	IMP2	P46972	177 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	SDH7	Q04401	133 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	ORM2	Q06144	216 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	CDC7	P06243	507 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	YCR025C	P25352	136 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	VHS2	P40463	436 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	YFL067W	P43537	175 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	ILM1	P47155	203 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	YGL117W	P53133	265 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	ORM1	P53224	222 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	HCH1	P53834	153 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	MSH5	Q12175	901 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	CRC1	Q12289	327 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	SCM3	Q12334	223 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	AIM24	P47127	394 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	CPR8	P53728	308 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	IZH1	Q03419	316 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	TMA17	Q12513	150 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	GPX2	P38143	162 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	HST4	P53688	370 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	MRP17	P28778	131 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	SPC1	P46965	94 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	TOM7	P53507	60 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	ATP23	P53722	227 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	VPS28	Q02767	242 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	SNO1	Q03144	224 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	PEX27	Q08580	376 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	CCW12	Q12127	133 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	AYT1	Q12226	474 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	YPL229W	Q99395	206 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF2	YGR129W	YKL162C	P36052	402 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	MRPL4	P36517	319 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	HPA3	P39979	161 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	AIM25	P47140	327 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	YCT1	Q12235	531 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	ERV2	Q12284	196 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	FCY2	P17064	533 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	ODC1	Q03028	310 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	YPL264C	Q08980	353 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.94	□□□□□ -1.78	not detected
SYF2	YGR129W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	TIR2	P33890	251 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	MRPL3	P36516	390 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	SFT2	P38166	215 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	MBA1	P38300	278 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	YHR022C	P38763	256 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	PBA1	Q05778	276 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	SEC22	P22214	214 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	ATG27	P46989	271 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	NIF3	P53081	288 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	MGR3	Q04472	501 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	COA4	Q05809	96 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	DDI2	P0CH63	225 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	DDI3	P0CH64	225 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	YPS5	P53057	165 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	JLP2	P40206	208 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	YJR096W	P47137	282 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	PKP2	P53170	491 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	PDR17	P53844	350 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78

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