RNA–Protein interactions for RNA: YGL103W

RPL28, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L28, yeast

Gene RPL28, Length 450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL28	YGL103W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPL28	YGL103W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPL28	YGL103W	ECO1	P43605	281 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL28	YGL103W	UBC13	P52490	153 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL28	YGL103W	NUP53	Q03790	475 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL28	YGL103W	YHP1	Q04116	353 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL28	YGL103W	MSC3	Q05812	728 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL28	YGL103W	LIP2	Q06005	328 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL28	YGL103W	MRL1	Q06815	381 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL28	YGL103W	CSM4	Q08955	156 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL28	YGL103W	RKI1	Q12189	258 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL28	YGL103W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL28	YGL103W	VPS63	O13549	108 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YMR31	P19955	123 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YCR007C	P25354	239 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	QRI5	P32344	111 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	MRPS5	P33759	307 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	PMU1	P36069	295 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	HAC1	P41546	238 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	EGT2	P42835	1041 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YGL118C	P53132	145 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	SDS23	P53172	527 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YNR064C	P53750	290 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	POS5	Q06892	414 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	RFM1	Q12192	310 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YPS3	Q12303	508 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	NUD1	P32336	851 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	MRPL39	P36533	70 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YHR173C	P38864	112 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	UME6	P39001	836 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	PSD1	P39006	500 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YER188W	P40103	239 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	SAS2	P40963	338 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	PRY1	P47032	299 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	COX16	P47081	118 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YDL183C	P48569	320 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YGL230C	P53074	147 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	CPD1	P53314	239 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YNR071C	P53757	342 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	MRPL19	P53875	158 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	UPS3	Q04006	179 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	DAP1	Q12091	152 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	SAL1	D6W196	494 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	PRY2	P36110	329 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	SOH1	P38633	127 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	AGE2	P40529	298 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	RAV2	Q03956	351 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	RNH203	Q12338	110 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	SEC11	P15367	167 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YER084W	P40057	128 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	HUA1	P40325	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	COX18	P53239	316 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	TOM7	P53507	60 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	ATP19	P81451	68 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	FIT2	Q08906	153 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	FAB1	P34756	2278 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	MRS1	P07266	363 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	ANB1	P19211	157 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	MRP49	P32388	137 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YAR068W	P39564	161 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	BDH1	P39714	382 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	GON7	P46984	123 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	DPP1	Q05521	289 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL28	YGL103W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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