RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W YMR082CQ04276 118 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YOL024WQ08172 172 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YLR363W-AQ3E747 85 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RIM15P43565 1770 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W POR1P04840 283 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YLL053CP0CD98 152 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W MSI1P13712 422 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W LRE1P25579 583 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ATS1P31386 333 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RIM1P32445 135 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W MSN2P33748 704 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PHO89P38361 574 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YER079WP40052 210 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TES1P41903 349 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W SFT1P43682 97 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W AIM25P47140 327 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W BAT2P47176 376 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PRM8P53174 237 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W CAX4P53223 239 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YGR219WP53307 113 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W BET5Q03630 159 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YMR103CQ04436 120 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RAF1Q06891 181 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W DGA1Q08650 418 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W IZH2Q12442 317 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W MYO1P08964 1928 aa2.91□□□□□ -1.94
VFA1YER128W FKS1P38631 1876 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.94
VFA1YER128W GSC2P40989 1895 aa2.9□□□□□ -1.94
VFA1YER128W COX5AP00424 153 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W OPI3P05375 206 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MRS1P07266 363 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W KRE1P17260 313 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W CDC5P32562 705 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MTC7P32633 139 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YKL102CP34249 101 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W PAU16P35994 123 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W SDS24P38314 527 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W ARC40P38328 384 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W CYB5P40312 120 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YPL073CP40323 161 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YJL213WP40896 331 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RRT5P43607 289 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W UBX6P47049 396 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YGL262WP53054 175 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W EMC4P53073 190 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W LSM3P57743 89 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W IRC15Q02733 499 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W VPS71Q03433 280 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W CRD1Q07560 283 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YOL159CQ08300 171 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YOR387CQ08910 206 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YLR049CQ12110 428 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RFM1Q12192 310 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa2.9□□□□□ -1.95
VFA1YER128W FKS3Q04952 1785 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W FLO11P08640 1367 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W HEM4P06174 275 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YGL010WP25338 174 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YIH1P25637 258 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YCR085WP25650 117 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YCR099CP25657 155 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W FMP46P36141 133 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W ECM29P38737 1868 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MST28P39552 234 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W EGT2P42835 1041 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YGR164WP53291 111 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YNR071CP53757 342 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YPR098CQ06089 161 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YPL162CQ12042 273 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W JID1Q12350 301 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MHF2Q3E829 80 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W IGO2Q9P305 131 aa2.89□□□□□ -1.95
VFA1YER128W APC1P53886 1748 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W TRP1P00912 224 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MRS3P10566 314 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W SDH3P33421 198 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MRPS5P33759 307 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MED6P38782 295 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W CCS1P40202 249 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W CUP9P41817 306 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W CTK2P46962 323 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W BNS1P50084 137 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W EST3Q03096 181 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YMR087WQ04299 284 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W HRT1Q08273 121 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W COX19Q3E731 98 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 81.3 ms