RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	TVP18	Q04767	167 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	RAD6	P06104	172 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	UBC5	P15732	148 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	SDH4	P37298	181 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YHR125W	P38831	101 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	DIE2	P50076	525 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	RSM10	Q03201	203 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	SYM1	Q06563	197 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	KRE5	P22023	1365 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YNR062C	P53748	327 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	MRPS8	Q03799	155 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	ANT1	Q06497	328 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	COX10	P21592	462 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	ASK1	P35734	292 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	CTR2	P38865	189 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YER188W	P40103	239 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	MPM1	P40364	252 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	REE1	P40893	198 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	BNI1	P41832	1953 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	RSM27	P53305	110 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	ODC2	Q99297	307 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	SAS5	Q99314	248 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	PDR11	P40550	1411 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	RAD10	P06838	210 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YER135C	P40082	130 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	GON7	P46984	123 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YMR252C	Q04814	134 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	UPS1	Q05776	175 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	UIP4	Q08926	304 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	ATP20	Q12233	115 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YLR422W	Q06409	1932 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	HAP3	P13434	144 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	SWD3	P38123	315 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	UMP1	P38293	148 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	ECM34	P38728	170 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YAR029W	P39549	74 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	SPC25	P40014	221 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	ECO1	P43605	281 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	SPG1	P50088	95 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YGR164W	P53291	111 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	SAY1	P53324	424 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YNR064C	P53750	290 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	RCE1	Q03530	315 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YDR102C	Q03864	110 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	RIM9	Q04734	239 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	RRT7	Q07829	113 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YCR050C	P25630	102 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	PEX4	P29340	183 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	CUP9	P41817	306 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	EAF6	P47128	113 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YMR295C	Q03559	197 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	PPT2	Q12036	173 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SLX8	YER116C	COX4	P04037	155 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	NSE4	P43124	402 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	HAL1	Q01766	294 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	LIP1	Q03579	150 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	SCP1	Q08873	200 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	GTT2	Q12390	233 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	SRL3	P36167	246 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	RRT1	P38192	103 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	GAA1	P39012	614 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	MPC3	P53311	146 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YMR103C	Q04436	120 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	KEI1	Q06346	221 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	SRL1	Q08673	210 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	FEX1	Q08913	375 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	FEX2	Q08991	375 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YOL085C	Q99345	113 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	RSF2	P46974	1380 aa		3	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	MDH2	P22133	377 aa		3	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	PAM17	P36147	197 aa		3	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	ERV15	P38312	142 aa		3	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	YIR035C	P40579	254 aa		3	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	PAM16	P42949	149 aa		3	□□□□□ -1.93
SLX8	YER116C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93

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