RNA–Protein interactions for RNA: YDL059C

RAD59, Transcript of Protein involved DNA double-strand break repair, yeast

Gene RAD59, Length 717 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD59	YDL059C	SPC25	P40014	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	CAF16	P43569	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	TAX4	P47030	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	UBC12	P52491	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	LST7	P53237	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	CPD1	P53314	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	SHH3	Q04487	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
RAD59	YDL059C	YCR022C	P25620	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	YBL059W	P34224	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	PRY2	P36110	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	RRT1	P38192	103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	SHG1	P38337	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	YGR219W	P53307	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	CAB4	P53332	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	ODC1	Q03028	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	TMA23	Q03525	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	CTR3	Q06686	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	MSK1	P32048	576 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	DER1	P38307	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	FIP1	P45976	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	SNN1	P48232	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	TOS8	P53147	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	YGR018C	P53211	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	CAF40	P53829	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	SDH7	Q04401	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	AVO2	Q04749	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	ATP14	Q12349	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	CYC3	P06182	269 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	ACP1	P32463	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	RIB5	P38145	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	MIC12	P38341	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	SAS2	P40963	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	ATC1	Q04005	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	PRM3	Q08931	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	COX19	Q3E731	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	CDC7	P06243	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	RTS2	P40962	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	ATG27	P46989	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD59	YDL059C	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	ECM25	P32525	599 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	SFT2	P38166	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	SIT1	P39980	628 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	AGE2	P40529	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	RPA43	P46669	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	MCM22	P47167	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	PAU4	P53427	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	POP5	P28005	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	SRB6	P32570	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	PET100	P38958	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	YNL194C	P40169	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	POR2	P40478	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	HST4	P53688	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	TIM18	Q08749	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	AYT1	Q12226	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	LAS17	Q12446	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	LDS1	P31379	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	TIR2	P33890	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	TRS20	P38334	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	YPI1	P43587	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	DSK2	P48510	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	YNR071C	P53757	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	PAU1	P0CE88	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	PAU14	P0CE89	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	PAU6	P0CE90	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	PAU18	P0CE91	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	PAU8	P0CE92	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	PAU11	P0CE93	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	DDI2	P0CH63	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	DDI3	P0CH64	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	PAU13	P38725	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD59	YDL059C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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