RNA–Protein interactions for RNA: YBR246W

RRT2, Transcript of Methylesterase performing penultimate step of diphthamide biosynthesis, yeast

Gene RRT2, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT2	YBR246W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	IRC22	P40006	225 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	SHO1	P40073	367 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	OST3	P48439	350 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	MIC26	P50087	233 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	APS2	Q00381	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	RSM23	Q01163	450 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	CSI2	Q08054	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	FRE8	Q12209	686 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	ERV2	Q12284	196 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	PAI3	P01094	68 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	ATP10	P18496	279 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	SPO13	P23624	291 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	DOG2	P38773	246 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	SRP14	P38985	146 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	PRM5	P40476	318 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	YIL012W	P40551	113 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	CUP9	P41817	306 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	YGR149W	P48236	432 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	PCP1	P53259	346 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	YIP3	P53633	176 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	RCE1	Q03530	315 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	DPP1	Q05521	289 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	PAU23	Q07987	124 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	PAU17	Q12370	124 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT2	YBR246W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	QCR9	P22289	66 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	RPA43	P46669	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	PDR17	P53844	350 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	TSA2	Q04120	196 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	FLO9	P39712	1322 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	LST7	P53237	242 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	PAM18	Q07914	168 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	NAT5	Q08689	176 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	GEP5	Q12393	293 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	UTR5	P32630	166 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	SWD3	P38123	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YGR269W	P40326	108 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YCH1	P42937	148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	TIM10	P87108	93 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	MCH1	Q07376	486 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	FAB1	P34756	2278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YBL059W	P34224	193 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	DOG1	P38774	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YHR130C	P38834	111 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	OXA1	P39952	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	GPI2	P46961	280 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	TTI2	P47168	421 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	PGU1	P47180	361 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	DAD3	P69850	94 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	UBC7	Q02159	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YML122C	Q03207	126 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	VAR1	P02381	398 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	CWP1	P28319	239 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	HIT1	P46973	164 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	GEP7	P53171	287 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	SCW10	Q04951	389 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YKL102C	P34249	101 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YKL070W	P36087	169 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YIL029C	P40538	142 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	REE1	P40893	198 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YJR015W	P47090	510 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YGR050C	P53231	118 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	CRH1	P53301	507 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	SUR7	P54003	302 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RRT2	YBR246W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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