RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516032.1

RNU6-1334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1334P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PRSS50Q9UI38 385 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C2orf81A6NN90 581 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 E7EVH7 732 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PROM1O43490 865 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KINO60870 393 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LRIG2O94898 1065 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GGPS1O95749 300 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 F9P00740 461 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PDHA1P08559 390 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UBL4AP11441 157 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TNNT1P13805 278 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NPPBP16860 134 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CIITAP33076 1130 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ETV3P41162 512 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC12A3P55017 1021 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CBX3Q13185 183 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GLRX5Q86SX6 157 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 METTL6Q8TCB7 284 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NCSTNQ92542 709 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C3orf49Q96BT1 292 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C1orf21Q9H246 121 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GREM2Q9H772 168 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TDP1Q9NUW8 608 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DKK3Q9UBP4 350 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 USP18Q9UMW8 372 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DERAQ9Y315 318 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RGSL1A5PLK6 1076 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 A8MXE2 369 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BTN3A1O00481 513 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 STX16O14662 325 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SMPD2O60906 423 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PCDH8O95206 1070 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 METTL18O95568 372 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FTCDO95954 541 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HEXBP07686 556 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CELA3BP08861 270 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GSTM1P09488 218 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CPA1P15085 419 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NFKBIAP25963 317 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GP5P40197 560 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 AMPHP49418 695 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RARSP54136 660 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC26A5P58743 744 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZBTB16Q05516 673 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PPP3CAQ08209 521 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DMTNQ08495 405 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC13A2Q13183 592 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 METTL23Q86XA0 190 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LZTR1Q8N653 840 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms