RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P YCR022CP25620 114 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P MRP17P28778 131 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P SPT14P32363 452 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P SUA5P32579 426 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YKL162CP36052 402 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YBL071CP38185 102 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P PTC7P38797 343 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P SNF11P38956 169 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P AIM20P40451 204 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P POR2P40478 281 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P LCB3P47013 409 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P LSM1P47017 172 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YJR015WP47090 510 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P MSO1P53604 210 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P FYV6P53913 173 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P COX12Q01519 83 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P ODC1Q03028 310 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P DCS1Q06151 350 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P ATG39Q06159 398 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P RRT7Q07829 113 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P TIM18Q08749 192 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YCT1Q12235 531 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P POM34Q12445 299 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P COA2Q3E823 68 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P PIS1P06197 220 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR213WP0CI67 198 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P ZRC1P20107 442 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YCR001WP25347 104 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P TIR2P33890 251 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P CMC1P36064 111 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P SHB17P36136 271 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P CSH1P38287 376 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P BDH1P39714 382 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P GLE2P40066 365 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YER135CP40082 130 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YKE4P40544 346 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P RTS2P40962 232 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P GPI2P46961 280 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P ATG27P46989 271 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P GNP1P48813 663 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P NIF3P53081 288 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P TPN1P53099 579 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P GPG1P53130 126 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YAP1802P53309 568 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P HCH1P53834 153 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P PDR17P53844 350 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YIF1P53845 314 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P SMX3P54999 86 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P HAL1Q01766 294 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P UBC7Q02159 165 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P FRQ1Q06389 190 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO92Q06390 306 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P ARR3Q06598 404 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P ENV7Q12003 364 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD28Q12021 506 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P TRM13Q12383 476 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P AIM45Q12480 344 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR146W-AQ2V2P1 62 aa1.96□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC7P06243 507 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P ARG80P07249 177 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P NHP6BP11633 99 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P GCN3P14741 305 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P MLF3P32047 452 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM25P32525 599 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P UPS2P35200 230 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P MRPL3P36516 390 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YBR242WP38331 238 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P RTC3P38804 111 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P HUA1P40325 198 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P HXT14P42833 540 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YJR111CP47148 283 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P PKP2P53170 491 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR018CP53211 109 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YIP3P53633 176 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P GPI15P53961 229 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P DID2P69771 204 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P TIM44Q01852 431 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P SDH7Q04401 133 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P LDS2Q08218 356 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YOL160WQ08321 113 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL264CQ08980 353 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YPS3Q12303 508 aa1.95□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P ERS1P17261 260 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YCR025CP25352 136 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P POP5P28005 173 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P PHD1P36093 366 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P LSM2P38203 95 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P VMA22P38784 181 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P MIG3P39943 394 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YIL077CP40508 320 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P YFR035CP43608 114 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P MIC27P50945 234 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P SHH3Q04487 196 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P CTR3Q06686 241 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P STP4Q07351 490 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P AYT1Q12226 474 aa1.94□□□□□ -2.1
tW(CCA)PtW(CCA)P TAL1P15019 335 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.3 ms