RNA–Protein interactions for RNA: YPR074C

TKL1, Transcript of Transketolase, yeast

Gene TKL1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TKL1	YPR074C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	DSS4	P32601	143 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	SDH4	P37298	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	PAM16	P42949	149 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	SCW11	P53189	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	RCE1	Q03530	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	DGA1	Q08650	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	COX4	P04037	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	SNF4	P12904	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	SNF2	P22082	1703 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	TOS2	P50078	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	SRP21	P32342	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	YHR140W	P38842	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	AVT2	P39981	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	CAT5	P41735	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
TKL1	YPR074C	KEI1	Q06346	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	RFM1	Q12192	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	MSW1	P04803	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	SPO13	P23624	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	ATG15	P25641	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	COX13	P32799	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	ATG12	P38316	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	GEP7	P53171	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	LOA1	Q06508	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	CSI2	Q08054	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	YOL131W	Q08270	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	MRS3	P10566	314 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	SWM2	P40342	146 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	EAF3	Q12432	401 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TKL1	YPR074C	HEM2	P05373	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YBR063C	P38083	404 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	POP8	P38208	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	GAS3	Q03655	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YFL065C	P43539	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	GPI2	P46961	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YPS5	P53057	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	SWS2	P53937	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	FIT3	Q08907	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YPR203W	Q08994	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YDR029W	Q12111	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
TKL1	YPR074C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	VMA11	P32842	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	CSH1	P38287	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	SYS1	P41544	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	NUP100	Q02629	959 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	ARN2	P38724	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	KEG1	P43614	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	UBC13	P52490	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	SPR6	Q01684	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YMR082C	Q04276	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	APS1	P35181	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	AVT7	P40501	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	CUP9	P41817	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	ATG18	P43601	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	FIP1	P45976	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	EAF6	P47128	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YGR164W	P53291	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	FIT1	Q04433	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YDL180W	Q12301	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TKL1	YPR074C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 65.6 ms