RNA–Protein interactions for RNA: YOR259C

RPT4, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT4, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT4	YOR259C	RPB11	P38902	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	TTI2	P47168	421 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	HHT1	P61830	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPT4	YOR259C	SWD3	P38123	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	MIX23	P38162	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YGR269W	P40326	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	GEP7	P53171	287 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	ATG21	Q02887	496 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	RUB1	Q03919	77 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	ARR3	Q06598	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	MCH1	Q07376	486 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YFH1	Q07540	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	SWT1	Q12104	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	USV1	Q12132	391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	FRE8	Q12209	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	FCY2	P17064	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	MIG1	P27705	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	SPS18	P32572	300 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YBL059W	P34224	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	AME1	P38313	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	SHO1	P40073	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YER134C	P40081	178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	MSY1	P48527	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YDR366C	P87287	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	SHH3	Q04487	196 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	TVP18	Q04767	167 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	LOA1	Q06508	300 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YOL118C	Q08259	102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	HNT3	Q08702	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	DAL3	P32459	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	DOG1	P38774	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YIL169C	P40442	995 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YIL163C	P40448	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	AGE2	P40529	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	GPI2	P46961	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	TAF4	P50105	388 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YIP5	P53108	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	CRH1	P53301	507 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	NUP53	Q03790	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	COQ11	Q05892	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	LDS2	Q08218	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YOR105W	Q08504	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	TOR1	P35169	2470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	HTB2	P02294	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	MSI1	P13712	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	HMX1	P32339	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YUH1	P35127	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	PAU16	P35994	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	PHD1	P36093	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	MOH1	P38191	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	DER1	P38307	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	COX15	P40086	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	PCL7	P40186	285 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	PGU1	P47180	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YGR050C	P53231	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YGR151C	P53287	111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	DUG3	P53871	357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	IZH1	Q03419	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	PAU23	Q07987	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	FIT3	Q08907	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	PAU17	Q12370	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	ATG40	Q99325	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	DIF1	O13577	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	LDB16	P25587	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YKL187C	P34231	750 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	PAM17	P36147	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YER188W	P40103	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	DFG10	P40526	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YJL028W	P47062	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	XPT1	P47165	209 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	RIM9	Q04734	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	TRI1	Q05024	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	RFU1	Q08003	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPT4	YOR259C	YLR415C	O13578	112 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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