RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	SCW11	P53189	542 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	GLO4	Q12320	285 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	PPH21	P23594	369 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YPL073C	P40323	161 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YIL169C	P40442	995 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ECO1	P43605	281 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YJR012C	P47087	207 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YGR079W	P53249	370 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YNR071C	P53757	342 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ATG41	Q12048	136 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ZRT1	P32804	376 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	SDS24	P38314	527 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	SLM6	P38343	150 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YER188W	P40103	239 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	REE1	P40893	198 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	DPP1	Q05521	289 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YLR302C	O13544	120 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	TIM12	P32830	109 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YIP4	P53093	235 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	CTR3	Q06686	241 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	PRR2	Q12310	699 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YMC1	P32331	307 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	SPS18	P32572	300 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RRT1	P38192	103 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YDR278C	Q05612	105 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YOR385W	Q08909	290 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	SCO1	P23833	295 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	DUT1	P33317	147 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YKL097C	P34245	136 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	not detected
RPO31	YOR116C	TDA2	P40045	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	EMC4	P53073	190 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	WSC2	P53832	503 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	HLR1	Q04429	423 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	BNA5	Q05979	453 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	STP4	Q07351	490 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	VPS68	Q12016	184 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YOS1	Q3E834	85 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	CHO1	P08456	276 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YCR023C	P25351	611 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YCK3	P39962	524 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	DUG3	P53871	357 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YFT2	Q06676	274 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	COX19	Q3E731	98 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	PCL2	P25693	308 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YPS1	P32329	569 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YPT10	P38146	199 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MPM1	P40364	252 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YDR209C	Q03480	137 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YDR102C	Q03864	110 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	FSH2	Q05015	223 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RAX2	Q12465	1220 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MRPL9	P31334	269 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ECM15	P35195	104 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	CSH1	P38287	376 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YER121W	P40076	114 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	SAS2	P40963	338 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	HNT2	P49775	206 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YOR376W	Q08900	122 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	REC104	P33323	182 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MTC6	P38849	526 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	PIR1	Q03178	341 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	UPS1	Q05776	175 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	PPT2	Q12036	173 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	REC114	P32841	428 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	PIC2	P40035	300 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YJR015W	P47090	510 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	CUZ1	P53899	274 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	CUP2	P15315	225 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YEL073C	P39974	107 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	LCL3	P53153	274 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	LST7	P53237	242 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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