RNA–Protein interactions for RNA: YNL321W

VNX1, Transcript of Calcium/H+ antiporter localized to the endoplasmic reticulum membrane, yeast

Gene VNX1, Length 2,727 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VNX1	YNL321W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	QRI5	P32344	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	SRB6	P32570	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	SRY1	P36007	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	ERV15	P38312	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	LST7	P53237	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	ABF2	Q02486	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	EST3	Q03096	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	DPP1	Q05521	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	UPS1	Q05776	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	RAF1	Q06891	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YEA6	P39953	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	RMD6	P39975	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	EGT2	P42835	1041 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	MMS2	P53152	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	ODC1	Q03028	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	ATG15	P25641	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	RPB7	P34087	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	ECM31	P38122	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	MTC6	P38849	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YER076C	P40049	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YER084W	P40057	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	APJ1	P53940	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	RRT7	Q07829	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	ATG40	Q99325	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	VPS28	Q02767	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	TDA6	Q06466	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	FRE8	Q12209	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	HEM4	P06174	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	CNB1	P25296	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YCR023C	P25351	611 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	UGX2	P32772	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	PRE3	P38624	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YEA4	P40004	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	EMC5	P40540	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	UBC11	P52492	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	FIT3	Q08907	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	SLM6	P38343	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	SPC25	P40014	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	SIM1	P40472	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	SIP18	P50263	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	MHR1	Q06630	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	AGC1	Q12482	902 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	MSI1	P13712	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	ERG2	P32352	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	CLB6	P32943	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	SNN1	P48232	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	CPD1	P53314	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	IMP1	P28627	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	COQ2	P32378	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	SWD3	P38123	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	FLX1	P40464	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YIL024C	P40543	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	TOS8	P53147	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	DGK1	Q12382	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YJR012C	P47087	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	ERG25	P53045	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YBR292C	P38357	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	LOA1	Q06508	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	GAT3	Q07928	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	HRD1	Q08109	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	POM33	Q12164	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	MST27	P53176	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	HHO1	P53551	258 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	FIT1	Q04433	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	MED7	Q08278	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VNX1	YNL321W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	MRPL28	P36527	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	ATP16	Q12165	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	COX19	Q3E731	98 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	CUE1	P38428	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	MCM22	P47167	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	SUR7	P54003	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.1 ms