RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	APS3	P47064	194 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	UFD1	P53044	361 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	MDM34	P53083	459 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YGL118C	P53132	145 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YDR249C	Q03787	373 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	EMI1	Q04406	187 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	SLD7	Q08457	257 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YPR011C	Q12251	326 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	ZRT3	P34240	503 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	SKG1	P36169	355 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YBR285W	P38354	144 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	COS8	P38723	381 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	AIM2	P39721	246 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	TTI2	P47168	421 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	BOR1	P53838	576 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	CNL1	Q06333	122 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YOR376W	Q08900	122 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	PRR2	Q12310	699 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	PST1	Q12355	444 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	SLO1	Q3E784	85 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	TSC3	Q3E790	80 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	MSB2	P32334	1306 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	NUM1	Q00402	2748 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	OCH1	P31755	480 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	SFC1	P33303	322 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.42	□□□□□ -1.86	not detected
RPS1B	YML063W	VMA7	P39111	118 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YJR015W	P47090	510 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YGR039W	P53225	103 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	TIM13	P53299	105 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	RSM27	P53305	110 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YDR366C	P87287	132 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YPL039W	Q03080	316 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YDR278C	Q05612	105 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	NEJ1	Q06148	342 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YPL264C	Q08980	353 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YPL162C	Q12042	273 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	KIN28	P06242	306 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	BET1	P22804	142 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	LDB16	P25587	256 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	GPI18	P38211	433 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	MIG3	P39943	394 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	AVT2	P39981	480 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	ARL3	Q02804	198 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	ECM19	Q06011	112 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	AKR2	Q12013	749 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	RIB3	Q99258	208 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RNP1	P32385	249 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	MRP49	P32388	137 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	SFK1	P35735	353 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YPL073C	P40323	161 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	SLM2	P53955	656 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	APS2	Q00381	147 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	OSH6	Q02201	448 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	GAS3	Q03655	524 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	THI74	Q04083	370 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	DAS2	Q12084	232 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YOR342C	Q12182	319 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YPL247C	Q12523	523 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	Q0255	P03881	472 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	CCA1	P21269	546 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YET1	P35723	206 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	NSG1	P38837	291 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	YAR068W	P39564	161 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	HPM1	P40481	377 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	GLC8	P41818	229 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS1B	YML063W	ORM1	P53224	222 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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