RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W RPR2P40571 144 aa6.67□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W YGR018CP53211 109 aa6.67□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W LDS2Q08218 356 aa6.67□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W FMP23P38231 175 aa6.66□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W LAG1P38703 411 aa6.66□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W YMR244WQ04018 355 aa6.66□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W YCR001WP25347 104 aa6.65□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W CMC1P36064 111 aa6.65□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W PHD1P36093 366 aa6.65□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W AVT5P38176 459 aa6.65□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W BOL3P39724 118 aa6.65□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W RTS2P40962 232 aa6.65□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W RBL2P48606 106 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W YAP1802P53309 568 aa6.65□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W YOR385WQ08909 290 aa6.65□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W MSH5Q12175 901 aa6.65□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W YCR022CP25620 114 aa6.64□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W ERV15P38312 142 aa6.64□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W GLE2P40066 365 aa6.64□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W GVP36P40531 326 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W GPI2P46961 280 aa6.64□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W LCB3P47013 409 aa6.64□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W YPR195CQ06594 109 aa6.64□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W QCR2P07257 368 aa6.63□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W VMA22P38784 181 aa6.63□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W YIR035CP40579 254 aa6.63□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W YIP3P53633 176 aa6.63□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W SGF11Q03067 99 aa6.63□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W FRQ1Q06389 190 aa6.63□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W BDH1P39714 382 aa6.62□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W AIM25P47140 327 aa6.62□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W MRPS8Q03799 155 aa6.62□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W IZH3Q07959 543 aa6.62□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W MBA1P38300 278 aa6.61□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W MIG3P39943 394 aa6.61□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W JLP2P40206 208 aa6.61□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W LSM1P47017 172 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W VPS28Q02767 242 aa6.61□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W POS5Q06892 414 aa6.61□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W YHR213WP0CI67 198 aa6.6□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W MRP17P28778 131 aa6.6□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W RRF1P38771 230 aa6.6□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W YER135CP40082 130 aa6.6□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W HCH1P53834 153 aa6.6□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W DCS1Q06151 350 aa6.6□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W IES3Q12345 250 aa6.6□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W CDC7P06243 507 aa6.59□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W HXT14P42833 540 aa6.59□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W LST7P53237 242 aa6.59□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W YLR224WQ05947 369 aa6.59□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W VAM10Q08474 114 aa6.59□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W YPS3Q12303 508 aa6.59□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa6.59□□□□□ -1.35
YLR349WYLR349W CSH1P38287 376 aa6.58□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W SNX4P47057 423 aa6.58□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W USV1Q12132 391 aa6.58□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W SAL1D6W196 494 aa6.57□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W CYC7P00045 113 aa6.57□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W PIS1P06197 220 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W FCY2P17064 533 aa6.57□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W IMP2P46972 177 aa6.57□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W YCT1Q12235 531 aa6.57□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W ERS1P17261 260 aa6.56□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W ZRC1P20107 442 aa6.56□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W AFR1P33304 620 aa6.56□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W YKL162CP36052 402 aa6.56□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W YJR015WP47090 510 aa6.56□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W NIF3P53081 288 aa6.56□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W TPI1P00942 248 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W UBC7Q02159 165 aa6.55□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W YOL160WQ08321 113 aa6.55□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W SEC22P22214 214 aa6.54□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W SER2P42941 309 aa6.54□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W HST4P53688 370 aa6.54□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W YPL162CQ12042 273 aa6.54□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W RDI1Q12434 202 aa6.54□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W YMR316C-AI2HB70 103 aa6.53□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W MCM22P47167 239 aa6.53□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W SDH7Q04401 133 aa6.53□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W NKP1Q12493 238 aa6.53□□□□□ -1.36
YLR349WYLR349W PPQ1P32945 549 aa6.52□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W GNP1P48813 663 aa6.52□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W YPL264CQ08980 353 aa6.52□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W AYT1Q12226 474 aa6.52□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W COA2Q3E823 68 aa6.52□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data6.51□□□□□ -1.37not detected
YLR349WYLR349W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W ATG27P46989 271 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 86.3 ms