RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W GPM1P00950 247 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W YCR022CP25620 114 aa6.65□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W SIP1P32578 815 aa6.65□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W BDH1P39714 382 aa6.65□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W NIF3P53081 288 aa6.65□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W HAL1Q01766 294 aa6.65□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W VPS28Q02767 242 aa6.65□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W NKP1Q12493 238 aa6.65□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W ERS1P17261 260 aa6.64□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W FPR2P32472 135 aa6.64□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W HXT14P42833 540 aa6.64□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W GPI2P46961 280 aa6.64□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W YLR224WQ05947 369 aa6.64□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W IES3Q12345 250 aa6.64□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W CYC7P00045 113 aa6.63□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W CMC1P36064 111 aa6.63□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W CSH1P38287 376 aa6.63□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W YIP3P53633 176 aa6.63□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W LSM7P53905 115 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W RDI1Q12434 202 aa6.63□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W YKL162CP36052 402 aa6.62□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W VMA22P38784 181 aa6.62□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W HCH1P53834 153 aa6.62□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W YMR244WQ04018 355 aa6.62□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W SDH7Q04401 133 aa6.62□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W YPL162CQ12042 273 aa6.62□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa6.62□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W ZRC1P20107 442 aa6.61□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W RRF1P38771 230 aa6.61□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W TPN1P53099 579 aa6.61□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W SGF11Q03067 99 aa6.61□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W TRM13Q12383 476 aa6.61□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W PRM7Q12459 698 aa6.61□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W PIS1P06197 220 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W YHR213WP0CI67 198 aa6.6□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W SAP30P38429 201 aa6.6□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W GAT4P40569 121 aa6.6□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W ORM1P53224 222 aa6.6□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W LST7P53237 242 aa6.6□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W POS5Q06892 414 aa6.6□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W YPL264CQ08980 353 aa6.6□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W SEC22P22214 214 aa6.59□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W SUA5P32579 426 aa6.59□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W GLE2P40066 365 aa6.59□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W YIR035CP40579 254 aa6.59□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W RAI1P53063 387 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W GPG1P53130 126 aa6.59□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W UBC7Q02159 165 aa6.59□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W MRPS8Q03799 155 aa6.59□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W VAM10Q08474 114 aa6.59□□□□□ -1.35
CPD1YGR247W TPI1P00942 248 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W CDC7P06243 507 aa6.58□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W FCY2P17064 533 aa6.58□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W SPT14P32363 452 aa6.58□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W ECM25P32525 599 aa6.58□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W RPR2P40571 144 aa6.58□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W LCB3P47013 409 aa6.58□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W IMP2P46972 177 aa6.57□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W SNX4P47057 423 aa6.57□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W YGR025WP53216 100 aa6.57□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W HST4P53688 370 aa6.57□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W YIF1P53845 314 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W PHO92Q06390 306 aa6.57□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W YER135CP40082 130 aa6.56□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W PDR17P53844 350 aa6.56□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W LOA1Q06508 300 aa6.56□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W YPR063CQ12160 140 aa6.56□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W MIG3P39943 394 aa6.55□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W MCM22P47167 239 aa6.55□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W YCR001WP25347 104 aa6.54□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W MRPL3P36516 390 aa6.54□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W YPC1P38298 316 aa6.54□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W YJR015WP47090 510 aa6.54□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W USV1Q12132 391 aa6.54□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W COA2Q3E823 68 aa6.54□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W RPN13O13563 156 aa6.53□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W ARG80P07249 177 aa6.53□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W SPS2P08459 502 aa6.53□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W ODC1Q03028 310 aa6.53□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W IZH1Q03419 316 aa6.53□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W YOL160WQ08321 113 aa6.53□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W AYT1Q12226 474 aa6.53□□□□□ -1.36
CPD1YGR247W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data6.52□□□□□ -1.37not detected
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