RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	DFG10	P40526	253 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	ATG41	Q12048	136 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	RTT103	Q05543	409 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	MET17	P06106	444 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YCR001W	P25347	104 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	GPI2	P46961	280 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	SNX4	P47057	423 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	EST3	Q03096	181 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	POS5	Q06892	414 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	LDS2	Q08218	356 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	PRM7	Q12459	698 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	FMT1	P32785	401 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YBL071C	P38185	102 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YIP3	P53633	176 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	IZH3	Q07959	543 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	RNP1	P32385	249 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	PCL6	P40038	420 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YIL077C	P40508	320 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	RTS2	P40962	232 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YGR025W	P53216	100 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	DYN2	Q02647	92 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	KEI1	Q06346	221 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	PAM18	Q07914	168 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	LCL2	Q08045	131 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	ATG5	Q12380	294 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	ZRC1	P20107	442 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	POP5	P28005	173 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	SEC66	P33754	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	MIG3	P39943	394 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YER135C	P40082	130 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	GRX3	Q03835	250 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	THI74	Q04083	370 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	SCP1	Q08873	200 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	PET20	Q99373	253 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	ANB1	P19211	157 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	CMC1	P36064	111 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	AVT5	P38176	459 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	SYM1	Q06563	197 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	POM34	Q12445	299 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	PRM4	Q12498	284 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	CUP2	P15315	225 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	HOT13	P36078	116 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	COS8	P38723	381 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	GLE2	P40066	365 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	CAT5	P41735	233 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	LCB3	P47013	409 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	YGR018C	P53211	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	RCF1	Q03713	159 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	YCR022C	P25620	114 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
SYF2	YGR129W	BDH1	P39714	382 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	YJR015W	P47090	510 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	CPR4	P25334	318 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	POP8	P38208	133 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	CSH1	P38287	376 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	LAG1	P38703	411 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	WSS1	P38838	269 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	YIR035C	P40579	254 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	YGR050C	P53231	118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	GIM3	P53900	129 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	LOA1	Q06508	300 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	VMA16	P23968	213 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	ELF1	P36053	145 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	MCM22	P47167	239 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	SPO19	Q03029	223 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	ATG33	Q06485	197 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	YPS3	Q12303	508 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	RRF1	P38771	230 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	HXT14	P42833	540 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYF2	YGR129W	UBC7	Q02159	165 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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