RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W MPC1P53157 130 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W VHT1P53241 593 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W CDC14Q00684 551 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W GAS3Q03655 524 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YMR166CQ03829 368 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W VBA1Q04301 562 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TRI1Q05024 226 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YLR042CQ07990 161 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W FCY1Q12178 158 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ERV2Q12284 196 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W COX17Q12287 69 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W COX1P00401 534 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W CPA1P07258 411 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TY2A-CP25383 438 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PUP3P25451 205 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W MIG1P27705 504 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W POP5P28005 173 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W URA10P30402 227 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W SRP21P32342 167 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W MKK1P32490 508 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W MRPL6P32904 214 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RIM2P38127 377 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ATG12P38316 186 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TRS20P38334 175 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RPB11P38902 120 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data2.94□□□□□ -1.94not detected
VFA1YER128W VHS2P40463 436 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W SAS2P40963 338 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ARP3P47117 449 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W HMS2P47175 358 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W GEP7P53171 287 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RNH201P53942 307 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W HSK3P69852 69 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W NUP100Q02629 959 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TY2A-DR2Q03483 438 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W MSS11Q03825 758 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TY2A-BQ12260 438 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TY2A-OR2Q12293 438 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TY2A-DR1Q12392 438 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TY2A-OR1Q12439 438 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YLR412C-AQ3E742 68 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YPL119C-AQ3E751 87 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W SPO24Q3E752 67 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TY2A-DR3Q99303 438 aa2.94□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ECM12O13529 151 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W CHO1P08456 276 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ERG8P24521 451 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PRE2P30656 287 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W SPS18P32572 300 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W VMA11P32842 164 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YJL193WP39542 402 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PEX22P39718 180 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W NSA2P40078 261 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YNL198CP40166 100 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.93□□□□□ -1.94not detected
VFA1YER128W CWP2P43497 92 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W VEL1P53058 206 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W CAB4P53332 305 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YLR152CP54072 576 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ADD37Q03233 198 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YDR209CQ03480 137 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W INP1Q03694 420 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W KEI1Q06346 221 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W FIT3Q08907 204 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YDL157CQ12082 118 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YDR029WQ12111 104 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YBL112CQ3E7Y4 105 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa2.93□□□□□ -1.94
VFA1YER128W BNI1P41832 1953 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W NUP192P47054 1683 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ILV1P00927 576 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YAR066WP0CX18 203 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YHR214WP0CX19 203 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YCR043CP25361 127 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ERG24P32462 438 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W MTR2P34232 184 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YBR063CP38083 404 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W MRPS9P38120 278 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ECM14P38836 430 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W HMF1P40037 129 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PEP8P40335 379 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PAU5P43575 122 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ATG27P46989 271 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W SPR6Q01684 191 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YPL039WQ03080 316 aa2.92□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YML079WQ03629 201 aa2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.4 ms