RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	VMA11	P32842	164 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	FIS1	P40515	155 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	OSH6	Q02201	448 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	VPS28	Q02767	242 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YOL029C	Q08187	201 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YPL247C	Q12523	523 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	VAR1	P02381	398 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	ATP15	P21306	62 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	AHT1	P29589	182 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	ETR1	P38071	380 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YIL152W	P40455	235 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YGL230C	P53074	147 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YKR005C	Q02203	525 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	FYV12	Q08559	129 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	KTI11	Q3E840	82 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	BNR1	P40450	1375 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	RNP1	P32385	249 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	RCN1	P36054	211 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	AIM18	P38884	321 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YND1	P40009	630 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YIL054W	P40524	105 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	IGD1	P43598	195 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	EST3	Q03096	181 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	TVP15	Q03860	143 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	PBA1	Q05778	276 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	NAT3	Q06504	195 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
SLX8	YER116C	IRC25	Q07951	179 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	HUT1	Q12520	339 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	SEC59	P20048	519 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
SLX8	YER116C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
SLX8	YER116C	SBH1	P52870	82 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	RNH202	Q05635	350 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YLR281C	Q05863	155 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	OCA6	Q12454	224 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	SPS2	P08459	502 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YCR043C	P25361	127 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	MRPL15	P36523	253 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	MIG3	P39943	394 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YER134C	P40081	178 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	EMC4	P53073	190 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	CAX4	P53223	239 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	ECM19	Q06011	112 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	ATO3	Q12359	275 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	FLO11	P08640	1367 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	REP2	P03872	296 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	ANB1	P19211	157 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	MRS4	P23500	304 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	RPB9	P27999	122 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	GPI18	P38211	433 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	RRT13	P40042	185 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	GAT4	P40569	121 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	DAD3	P69850	94 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	GAL83	Q04739	417 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YLR042C	Q07990	161 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YRF1-6	P53819	1859 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	TIM9	O74700	87 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	SFT2	P38166	215 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YBR090C	P38253	122 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YEL028W	P39989	153 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	not detected
SLX8	YER116C	YDR274C	P87283	123 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	TRM3	Q07527	1436 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	SGA1	P08019	549 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YBL059W	P34224	193 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	RPB11	P38902	120 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	YEA6	P39953	335 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	PHS1	P40857	217 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	DSK2	P48510	373 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	GEP7	P53171	287 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	ELC1	Q03071	99 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SLX8	YER116C	NHP10	Q03435	203 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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