RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W PAU8P0CE92 120 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PAU11P0CE93 120 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W CPR1P14832 162 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PCL1P24867 279 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W STP22P25604 385 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W ATG15P25641 520 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W HSP150P32478 413 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W MRPL15P36523 253 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PAU13P38725 120 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W IRC22P40006 225 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PAU10Q03050 120 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W CTS2Q06350 511 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PAU20Q08322 120 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W FYV7Q12247 151 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YOP1Q12402 180 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PAU9Q3E770 120 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YCL001W-BQ96VH2 84 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W MDH2P22133 377 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W SPO13P23624 291 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W AHT1P29589 182 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W HMX1P32339 317 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W HSP10P38910 106 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W NSA2P40078 261 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W TIF34P40217 347 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YJL213WP40896 331 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W SPG5P42933 373 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W WSC2P53832 503 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W CRZ1P53968 678 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W SEI1Q06058 285 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YLR030WQ07967 263 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W ERV2Q12284 196 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YPR014CQ6B0W2 109 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YLR365WQ7LIF2 110 aa4.57□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YDR157WA0A023PZE8 133 aa4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W SCO1P23833 295 aa4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W OCH1P31755 480 aa4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YPT53P36019 220 aa4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W MTC6P38849 526 aa4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YDR102CQ03864 110 aa4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W ATC1Q04005 294 aa4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W TSA2Q04120 196 aa4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W HUT1Q12520 339 aa4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YAL064W-BO13512 126 aa4.55□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W ATP5P09457 212 aa4.55□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PFS1P38872 237 aa4.55□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W CIS3P47001 227 aa4.55□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YDL186WP48568 277 aa4.55□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W LST7P53237 242 aa4.55□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W SAE3P89114 91 aa4.55□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W POM33Q12164 279 aa4.55□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W HUG1Q6Q5K6 68 aa4.55□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W COX5BP00425 151 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PEX4P29340 183 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W TOA2P32774 122 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W RPB7P34087 171 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W WSC4P38739 605 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W CUP9P41817 306 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W GLC8P41818 229 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YFL067WP43537 175 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W HIT1P46973 164 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PDR17P53844 350 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W DAD3P69850 94 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W FRQ1Q06389 190 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PIN3Q06449 215 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W NDE2Q07500 545 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YPL264CQ08980 353 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa4.54□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W URA5P13298 226 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W RPL30P14120 105 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W DAL80P26343 269 aa4.53□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W BAT1P38891 393 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W SWS2P53937 143 aa4.53□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W HHT1P61830 136 aa4.53□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W APS2Q00381 147 aa4.53□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YPL039WQ03080 316 aa4.53□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W RCE1Q03530 315 aa4.53□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PAM18Q07914 168 aa4.53□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W YOL029CQ08187 201 aa4.53□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W HNT3Q08702 217 aa4.53□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W FMP49A0A023PZB3 126 aa4.53□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W POR1P04840 283 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W AGA1P32323 725 aa4.53□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YKL075CP36083 450 aa4.53□□□□□ -1.69
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