RNA–Protein interactions for RNA: Q0120

BI4, Transcript of Mitochondrial mRNA maturase, yeast

Gene BI4, Length 1,917 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BI4	Q0120	RTC4	P53850	401 aa		0.74	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	PGA1	P53896	198 aa		0.74	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.74	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	UBC8	P28263	218 aa		0.73	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	YHL037C	P38733	133 aa		0.73	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	CGR1	P53188	120 aa		0.73	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	STF2	P16965	84 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	APA2	P22108	325 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	NSG1	P38837	291 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	SBH1	P52870	82 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	DAS2	Q12084	232 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	YOR342C	Q12182	319 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	TRX3	P25372	127 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	PIR1	Q03178	341 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BI4	Q0120	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	RRT1	P38192	103 aa		0.71	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	NRK1	P53915	240 aa		0.71	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	AIM34	Q03673	198 aa		0.71	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	UPS1	Q05776	175 aa		0.71	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	YOR015W	Q12169	119 aa		0.71	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	AHT1	P29589	182 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	ETR1	P38071	380 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	GAL83	Q04739	417 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	NSE4	P43124	402 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	YFL051C	P43552	160 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	YHP1	Q04116	353 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	ELP6	Q04868	273 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	GRX8	Q05926	109 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	AHC2	P25649	128 aa		0.69	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	UGX2	P32772	223 aa		0.69	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	CPR5	P35176	225 aa		0.69	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	GRX3	Q03835	250 aa		0.69	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	DGK1	Q12382	290 aa		0.69	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	YBL010C	P32788	280 aa		0.68	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	CAF4	P36130	643 aa		0.68	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	YKR041W	P36134	250 aa		0.68	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	DML1	Q03652	475 aa		0.68	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	FIT1	Q04433	528 aa		0.68	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	ATG41	Q12048	136 aa		0.68	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	YKL102C	P34249	101 aa		0.67	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	FMP32	P43557	207 aa		0.67	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	SNO1	Q03144	224 aa		0.67	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	SHH4	Q06236	168 aa		0.67	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.66	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	RIM9	Q04734	239 aa		0.66	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.66	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.66	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	SBH2	P52871	88 aa		0.66	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	GPI17	Q04080	534 aa		0.66	□□□□□ -2.3
BI4	Q0120	MAK31	P23059	88 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	SHG1	P38337	142 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	RFC2	P40348	353 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	SOL1	P50278	321 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	CCW12	Q12127	133 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	HSP30	P25619	332 aa		0.64	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.63	□□□□□ -2.31	not detected
BI4	Q0120	DCV1	P43595	202 aa		0.63	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	VPS28	Q02767	242 aa		0.63	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	AVO2	Q04749	426 aa		0.63	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	CLG1	P35190	452 aa		0.62	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	NVJ1	P38881	321 aa		0.62	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	YAR064W	P39563	99 aa		0.62	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	YKR005C	Q02203	525 aa		0.62	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	YOR214C	Q12282	236 aa		0.62	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.62	□□□□□ -2.31	RIP-Chip
BI4	Q0120	TTI2	P47168	421 aa		0.62	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	GRE1	Q08969	168 aa		0.62	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	YIL102C	P40488	101 aa		0.6	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	HOP2	P53187	214 aa		0.6	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	GRX5	Q02784	150 aa		0.6	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	YPR127W	Q06494	345 aa		0.6	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.6	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	HHT1	P61830	136 aa		0.6	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
BI4	Q0120	ATP7	P30902	174 aa		0.59	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YJR015W	P47090	510 aa		0.59	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YET3	Q07451	203 aa		0.59	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YEL073C	P39974	107 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	JAC1	P53193	184 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	CSH1	P38287	376 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	PAC10	P48363	199 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YGL230C	P53074	147 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YDC1	Q02896	317 aa		0.58	□□□□□ -2.32

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