RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372405.1

PTPRF-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-202ENST00000372405 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.66□□□□□ -0.06
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PTPRF-202ENST00000372405 TRIM11Q96F44 468 aa14.66□□□□□ -0.06
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PTPRF-202ENST00000372405 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.66□□□□□ -0.06
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PTPRF-202ENST00000372405 ZFP42Q96MM3 310 aa14.66□□□□□ -0.06
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PTPRF-202ENST00000372405 CARD9Q9H257 536 aa14.63□□□□□ -0.07
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PTPRF-202ENST00000372405 NOD1Q9Y239 953 aa14.63□□□□□ -0.07
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