RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P THI74Q04083 370 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P SCW10Q04951 389 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX10Q05568 337 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P SYM1Q06563 197 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P RXT3Q07458 294 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P PAM18Q07914 168 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P RKI1Q12189 258 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YBR255C-AQ3E776 120 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P BOL1Q3E793 110 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P COX2P00410 251 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P GPM1P00950 247 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P MRS3P10566 314 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P CAP2P13517 287 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P UTR5P32630 166 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC66P33754 206 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P SDH4P37298 181 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P LAG1P38703 411 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P IPI1P38803 334 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P MPC2P38857 129 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YAR068WP39564 161 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P IRC24P40580 263 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR210CP42942 411 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P AGX1P43567 385 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR219WP53307 113 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P NCE103P53615 221 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR274CP87283 123 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS28Q02767 242 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P SPO19Q03029 223 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P EST3Q03096 181 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P RCF1Q03713 159 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P TRI1Q05024 226 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P RRG8Q06109 277 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P MCM21Q06675 368 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR013CQ12145 317 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P PAA1Q12447 191 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P AGC1Q12482 902 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR011W-AQ3E807 68 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P TAR1Q8TGM6 124 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P CYC1P00044 109 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P CPR4P25334 318 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P ALK2P32789 676 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P MBA1P38300 278 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P ERV15P38312 142 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P MIC12P38341 106 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P DOG2P38773 246 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P DOG1P38774 246 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P NSA2P40078 261 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P CAF16P43569 289 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YPI1P43587 155 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P ERG25P53045 309 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR025WP53216 100 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P GTF1P53260 183 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P SSU72P53538 206 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P LSM7P53905 115 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P OCA2P53949 197 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P LRS4Q04087 347 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P FMP42Q04991 504 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P POS5Q06892 414 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YOL029CQ08187 201 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P NGL1Q08213 363 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P USV1Q12132 391 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P ATG31Q12421 196 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P TPI1P00942 248 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P CYC3P06182 269 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P QCR2P07257 368 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data1.99□□□□□ -2.09not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P SIP1P32578 815 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P AVT5P38176 459 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P RRT1P38192 103 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P CDS1P38221 457 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P RRF1P38771 230 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P WSS1P38838 269 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P ALG13P53178 202 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR050CP53231 118 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR224WQ05947 369 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YNG1Q08465 219 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR352WQ08816 343 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR385WQ08909 290 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P POC4Q12245 148 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL258W-AQ3E740 77 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC22P22214 214 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YCR016WP25617 290 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P TIP1P27654 210 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P PPQ1P32945 549 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P UTP11P34247 250 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P SRL3P36167 246 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P IES5P40060 125 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL194CP40169 301 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YIR035CP40579 254 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P TDA4P47153 279 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P MIC26P50087 233 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P ARO8P53090 500 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P LST7P53237 242 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P PRM7Q12459 698 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR316C-AI2HB70 103 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P SPS2P08459 502 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)PtW(CCA)P FCY2P17064 533 aa1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 113.3 ms