RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)L

tS(GCU)L, Transcript of Asparagine tRNA (tRNA-Asn), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tS(GCU)L, Length 80 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)LtS(GCU)L HTD2P38790 280 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L IRC18P47056 224 aa6.58□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L ARP3P47117 449 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L FMP42Q04991 504 aa6.58□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L TIM18Q08749 192 aa6.58□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L PET20Q99373 253 aa6.58□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L HOM6P31116 359 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L CDS1P38221 457 aa6.57□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L RTT103Q05543 409 aa6.57□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L YLR031WQ07978 186 aa6.57□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L SCP1Q08873 200 aa6.57□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L FEX1Q08913 375 aa6.57□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L FEX2Q08991 375 aa6.57□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L CAP2P13517 287 aa6.56□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L GIM3P53900 129 aa6.56□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L SYM1Q06563 197 aa6.56□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L CPR4P25334 318 aa6.55□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L UPS2P35200 230 aa6.55□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L RRT1P38192 103 aa6.55□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L LAG1P38703 411 aa6.55□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L LSM12P38828 187 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L DFG10P40526 253 aa6.55□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L GAT4P40569 121 aa6.55□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L MSO1P53604 210 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L AGC1Q12482 902 aa6.55□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L CYC7P00045 113 aa6.54□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L GPM1P00950 247 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L MST28P39552 234 aa6.54□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L MST27P53176 234 aa6.54□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L THI74Q04083 370 aa6.54□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L STP4Q07351 490 aa6.54□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L PAM18Q07914 168 aa6.54□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L YOR352WQ08816 343 aa6.54□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L SUS1Q6WNK7 96 aa6.54□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L RPL24BP24000 155 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L BOL3P39724 118 aa6.53□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L CAT5P41735 233 aa6.53□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L YAP1802P53309 568 aa6.53□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L OCA2P53949 197 aa6.53□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L HAL1Q01766 294 aa6.53□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L EST3Q03096 181 aa6.53□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L RXT3Q07458 294 aa6.53□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L LDS2Q08218 356 aa6.53□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L YBR255C-AQ3E776 120 aa6.53□□□□□ -1.36
tS(GCU)LtS(GCU)L ECM25P32525 599 aa6.52□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L YBL071CP38185 102 aa6.52□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L SNF11P38956 169 aa6.52□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L LSM1P47017 172 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L RBL2P48606 106 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L NRG1Q03125 231 aa6.52□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L YOR385WQ08909 290 aa6.52□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L POP5P28005 173 aa6.51□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L MIT1P40002 666 aa6.51□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L MCM21Q06675 368 aa6.51□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L IZH3Q07959 543 aa6.5□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L RNP1P32385 249 aa6.49□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L GPX2P38143 162 aa6.49□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L POP8P38208 133 aa6.49□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L RTC3P38804 111 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L SMX3P54999 86 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L TY1A-MR1Q04215 440 aa6.49□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L VAM10Q08474 114 aa6.49□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L MSH5Q12175 901 aa6.49□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L YPS3Q12303 508 aa6.49□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L ATG5Q12380 294 aa6.49□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L ERS1P17261 260 aa6.48□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L MBA1P38300 278 aa6.48□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L VMA22P38784 181 aa6.48□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L RPR2P40571 144 aa6.48□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L RTS2P40962 232 aa6.48□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L YGR050CP53231 118 aa6.48□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L SGF11Q03067 99 aa6.48□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data6.47□□□□□ -1.37not detected
tS(GCU)LtS(GCU)L SNU13P39990 126 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L NSA2P40078 261 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L GPI2P46961 280 aa6.47□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L DYN2Q02647 92 aa6.47□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L PAA1Q12447 191 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
tS(GCU)LtS(GCU)L SAL1D6W196 494 aa6.46□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L QCR2P07257 368 aa6.46□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L SIP1P32578 815 aa6.46□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L AVT5P38176 459 aa6.46□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L YHR122WP38829 231 aa6.46□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L YGR018CP53211 109 aa6.46□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L CPR8P53728 308 aa6.46□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L YPL162CQ12042 273 aa6.46□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa6.46□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L YOR011W-AQ3E807 68 aa6.46□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L FPR2P32472 135 aa6.45□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L ERV15P38312 142 aa6.45□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L COS8P38723 381 aa6.45□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L SNX4P47057 423 aa6.45□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L GTF1P53260 183 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L YIP3P53633 176 aa6.45□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L YMR244WQ04018 355 aa6.45□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L YCR022CP25620 114 aa6.44□□□□□ -1.38
tS(GCU)LtS(GCU)L PAN3P36102 679 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
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