RNA–Protein interactions for RNA: YPR119W

CLB2, Transcript of B-type cyclin involved in cell cycle progression, yeast

Gene CLB2, Length 1,476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cellular bud .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLB2	YPR119W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YML096W	Q04489	525 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	DAL4	Q04895	635 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	MRL1	Q06815	381 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YOL029C	Q08187	201 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YOR105W	Q08504	108 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.13	□□□□□ -1.59	not detected
CLB2	YPR119W	VPS68	Q12016	184 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	LDH1	P38139	375 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YBR220C	P38318	560 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	TEM1	P38987	245 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	POP2	P39008	433 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YAL037W	P39728	267 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YJL028W	P47062	111 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	VEL1	P53058	206 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	BRR6	P53062	197 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YGL230C	P53074	147 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	TPC1	P53257	314 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YPL039W	Q03080	316 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YPL264C	Q08980	353 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	TGS1	Q12052	315 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	CCH1	P50077	2039 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	RPB8	P20436	146 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	VMA3	P25515	160 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	OCH1	P31755	480 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	UME6	P39001	836 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YIL169C	P40442	995 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	HAC1	P41546	238 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	RLM1	Q12224	676 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YLL053C	P0CD98	152 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	PPA2	P28239	310 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	EMP70	P32802	667 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	REC114	P32841	428 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	PFS1	P38872	237 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YGR126W	P53274	230 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	ARR3	Q06598	404 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	PAM18	Q07914	168 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	HRD1	Q08109	551 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	FRE8	Q12209	686 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	SUT2	Q12286	268 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	SEC11	P15367	167 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	QDR3	P38227	689 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	TAE1	P38340	232 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	CYB5	P40312	120 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	MSY1	P48527	492 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YNR064C	P53750	290 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YML079W	Q03629	201 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	SEI1	Q06058	285 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	ATG40	Q99325	256 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CLB2	YPR119W	CYC7	P00045	113 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	CYT1	P07143	309 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	HMX1	P32339	317 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	HOG1	P32485	435 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	YHR180W	P38868	163 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	ELO1	P39540	310 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	YIL089W	P40500	205 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	COQ5	P49017	307 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	CRH1	P53301	507 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	NCE101	Q02820	53 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	TSA2	Q04120	196 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	YDR286C	Q05530	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	MIM1	Q08176	113 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	PFA4	Q12006	378 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	PIN2	Q12057	282 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	MCP1	Q12106	302 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	YOR343C	Q12484	108 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	INH1	P01097	85 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	YFL068W	P0CX99	160 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	YBR184W	P38299	523 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	WSC4	P38739	605 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	YAR1	P46683	200 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	YGL118C	P53132	145 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	YNR040W	P53736	256 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	LDS2	Q08218	356 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLB2	YPR119W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		5.07	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 281.2 ms