RNA–Protein interactions for RNA: YPR036W

VMA13, Transcript of Subunit H of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA13, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA13	YPR036W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	FCY2	P17064	533 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	NUP1	P20676	1076 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	LST4	P34239	828 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	FRM2	P37261	193 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	SDS24	P38314	527 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	YHR180W	P38868	163 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	YCH1	P42937	148 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	YIP4	P53093	235 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	BUD25	P85052	153 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	SEI1	Q06058	285 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	MCH4	Q08268	501 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	MRPL3	P36516	390 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	YIL060W	P40519	144 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	AIM25	P47140	327 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	VHT1	P53241	593 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	RAV2	Q03956	351 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	PEX30	Q06169	523 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	ERV2	Q12284	196 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	YOP1	Q12402	180 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VMA13	YPR036W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	UGX2	P32772	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YBR096W	P38256	230 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	GLE2	P40066	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	PGD1	P40356	397 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	MOB2	P43563	287 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YGR017W	P53210	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	SCO1	P23833	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	SLM6	P38343	150 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	RFC2	P40348	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	NRM1	P53718	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	SCS7	Q03529	384 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	MRX8	Q05473	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	ATP14	Q12349	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	ORT1	Q12375	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	SGA1	P08019	549 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	ECM14	P38836	430 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	VMA7	P39111	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	GLC8	P41818	229 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	MCM22	P47167	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	UFD1	P53044	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	BOR1	P53838	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	PET191	Q02772	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	MIM1	Q08176	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	CYC3	P06182	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	MRS1	P07266	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	STE4	P18851	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	PHD1	P36093	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YIL067C	P40514	678 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	UBC13	P52490	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	PCP1	P53259	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	HCH1	P53834	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	APS2	Q00381	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	IRC19	Q07843	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	SRL2	Q12020	392 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	ODC2	Q99297	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	PCL1	P24867	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	GEP4	P38812	185 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	TIR3	P40552	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	SYS1	P41544	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	HSK3	P69852	69 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	MRX11	Q03079	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	GAT3	Q07928	141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	SAL1	D6W196	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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