RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	CPR5	P35176	225 aa		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.18	□□□□□ -2.38	not detected
VIK1	YPL253C	YEA4	P40004	342 aa		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	FLX1	P40464	311 aa		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YFL065C	P43539	102 aa		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	ARO80	Q04052	950 aa		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	NAT3	Q06504	195 aa		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YOL014W	Q08110	124 aa		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	IRC23	Q08416	157 aa		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	FIT2	Q08906	153 aa		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	MDM32	Q12171	622 aa		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YDL180W	Q12301	547 aa		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	NUM1	Q00402	2748 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	COX8	P04039	78 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	TIR1	P10863	254 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	PAM17	P36147	197 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	TVP38	P36164	337 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	TRM5	P38793	499 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	SER2	P42941	309 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YFH7	P43591	353 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	MMS2	P53152	137 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	GET1	P53192	235 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	BNA7	Q04066	261 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YMR252C	Q04814	134 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	GRE1	Q08969	168 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YPR013C	Q12145	317 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	ODC2	Q99297	307 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	RAD9	P14737	1309 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	GSC2	P40989	1895 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	FMP27	Q06179	2628 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YPR117W	Q06116	2489 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	BPH1	P25356	2167 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	BNI1	P41832	1953 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	MDM35	O60200	86 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YPK2	P18961	677 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YHL042W	P38729	150 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YFL019C	P43576	117 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	UBC12	P52491	188 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YNL184C	P53876	108 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YLR460C	P54007	376 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	DAD4	P69851	72 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	IGO2	Q9P305	131 aa		0.17	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	UBR1	P19812	1950 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	TOR1	P35169	2470 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	JIP3	O13555	125 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	SEN2	P16658	377 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	PHO85	P17157	305 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	MGT1	P26188	188 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	ADE1	P27616	306 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	NTG1	P31378	399 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YKR041W	P36134	250 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	SOK1	P40317	901 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YNL033W	P53964	284 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	CWC27	Q02770	301 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	RCE1	Q03530	315 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	AIM36	Q03798	255 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	SHH3	Q04487	196 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YMR253C	Q04835	414 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	GET4	Q12125	312 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.15	□□□□□ -2.38
VIK1	YPL253C	TRX3	P25372	127 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RPB7	P34087	171 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	FMP23	P38231	175 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	MTW1	P39731	289 aa		0.15	□□□□□ -2.39

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