RNA–Protein interactions for RNA: YMR093W

UTP15, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP15, Length 1,542 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP15	YMR093W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	TIP20	P33891	701 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	CIN5	P40917	295 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	HIT1	P46973	164 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	UFD1	P53044	361 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MDM34	P53083	459 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	CWC27	Q02770	301 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	CAB5	Q03941	241 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	API2	Q04413	109 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	FIT1	Q04433	528 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	LDB18	Q07887	179 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PER33	Q12144	273 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	FYV7	Q12247	151 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RAX2	Q12465	1220 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PRM4	Q12498	284 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MOT1	P32333	1867 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	HTB2	P02294	131 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	URA6	P15700	204 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	GPI12	P23797	304 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PBN1	P25580	416 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	ATG15	P25641	520 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YPS1	P32329	569 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	DRE2	P36152	348 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	AIM29	P36154	155 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YEL073C	P39974	107 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PAU15	P40585	124 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	GLC8	P41818	229 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	UFE1	P41834	346 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PAC10	P48363	199 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	OST3	P48439	350 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	NUP57	P48837	541 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	COQ5	P49017	307 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PGA1	P53896	198 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YNL140C	P53910	189 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	APJ1	P53940	528 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YDC1	Q02896	317 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	ATC1	Q04005	294 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	BOP2	Q06150	570 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	CTR3	Q06686	241 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	HEM25	Q07534	307 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RRT7	Q07829	113 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YOR385W	Q08909	290 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PST1	Q12355	444 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YDL012C	Q12489	107 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	COA6	Q3E846	104 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SGA1	P08019	549 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	ATP5	P09457	212 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YPC1	P38298	316 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SHG1	P38337	142 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	TAE1	P38340	232 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SYS1	P41544	203 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YJR012C	P47087	207 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YJR056C	P47115	236 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SAE3	P89114	91 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RSM10	Q03201	203 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SHH3	Q04487	196 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	AVO2	Q04749	426 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PEX30	Q06169	523 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	FRQ1	Q06389	190 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YLR012C	Q07927	99 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YLR036C	Q07986	203 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RFU1	Q08003	200 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YLR118C	Q12354	227 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	ATG5	Q12380	294 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	COX19	Q3E731	98 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YOL085C	Q99345	113 aa		2.22	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	KIN28	P06242	306 aa		2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	PAU19	P0CE85	124 aa		2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	PAU21	P0CE86	164 aa		2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	PAU22	P0CE87	164 aa		2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	PAU3	P25610	124 aa		2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	YKL187C	P34231	750 aa		2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	POP8	P38208	133 aa		2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	YBR096W	P38256	230 aa		2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	SUR2	P38992	349 aa		2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	SPC25	P40014	221 aa		2.21	□□□□□ -2.06
UTP15	YMR093W	OSW5	P40219	148 aa		2.21	□□□□□ -2.06

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