RNA–Protein interactions for RNA: YMR058W

FET3, Transcript of Ferro-O2-oxidoreductase, yeast

Gene FET3, Length 1,911 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FET3	YMR058W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	MMT2	Q08970	484 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	ATG41	Q12048	136 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	PRM4	Q12498	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	CTA1	P15202	515 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	INO2	P26798	304 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	MRPL28	P36527	147 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	IRC24	P40580	263 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	PAM16	P42949	149 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	CIN2	P46670	268 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	YLR460C	P54007	376 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	CWC27	Q02770	301 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	MET31	Q03081	177 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	PCL9	Q12477	304 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	PUT1	P09368	476 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	AGA1	P32323	725 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	MTC6	P38849	526 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	SNM1	P40993	198 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	PEX30	Q06169	523 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	HEM25	Q07534	307 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	MRX4	Q12467	430 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FET3	YMR058W	SEC22	P22214	214 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	YOX1	P34161	385 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	SHG1	P38337	142 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	COX14	P39103	70 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	YLR152C	P54072	576 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	DPP1	Q05521	289 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	KIN28	P06242	306 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	SEC59	P20048	519 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	LDB16	P25587	256 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	SNC2	P33328	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	SFK1	P35735	353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	IGO1	P53897	168 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	SUR7	P54003	302 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	MRP17	P28778	131 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
FET3	YMR058W	SHE1	P38200	338 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	RPS27B	P38711	82 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	CHS7	P38843	316 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	PET8	P38921	284 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	YIL152W	P40455	235 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	ICE2	P40499	491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	CAT5	P41735	233 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	IKS1	P47042	667 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	MMS2	P53152	137 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	YDC1	Q02896	317 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	SEC17	P32602	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	CLB6	P32943	380 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	GLC8	P41818	229 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	HEM4	P06174	275 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	STE7	P06784	515 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	ATG15	P25641	520 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	AHC2	P25649	128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	MIX23	P38162	196 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	LCB3	P47013	409 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	OST3	P48439	350 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	SOL1	P50278	321 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	NRK1	P53915	240 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	GMC1	Q04399	608 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	COQ10	Q08058	207 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	EMC5	P40540	141 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	UFD1	P53044	361 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	AAH1	P53909	347 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	CYT2	Q00873	224 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	FYV7	Q12247	151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FET3	YMR058W	MCT1	Q12283	360 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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