RNA–Protein interactions for RNA: YMR007W

YMR007W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR007W, Length 381 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR007WYMR007W AUA1P32450 94 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W HTD2P38790 280 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W POP2P39008 433 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W RAI1P53063 387 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W CRH1P53301 507 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W VBA1Q04301 562 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W SCW10Q04951 389 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W KEI1Q06346 221 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W YOL029CQ08187 201 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W RPL3P14126 387 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W NOP1P15646 327 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W MRS4P23500 304 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W ECM33P38248 429 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W CAT5P41735 233 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W CPD1P53314 239 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W YDR274CP87283 123 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W YMR181CQ03231 154 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W MGR3Q04472 501 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W ATP3P38077 311 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W YGR219WP53307 113 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W ATG31Q12421 196 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W PET20Q99373 253 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W YPS1P32329 569 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W GPX2P38143 162 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W MIC12P38341 106 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W YPT31P38555 223 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W LAG1P38703 411 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W MSE1P48525 536 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W ERV29P53337 310 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W SPO19Q03029 223 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W MIR1P23641 311 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W FMT1P32785 401 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W PDC2P32896 925 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W LSM12P38828 187 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W JLP2P40206 208 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W LST8P41318 303 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W CPR8P53728 308 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W ERV25P54837 211 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W TRI1Q05024 226 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W PEX10Q05568 337 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W RRG8Q06109 277 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W SCP1Q08873 200 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W YPI1P43587 155 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W IRC23Q08416 157 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W RAD28Q12021 506 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W MSH5Q12175 901 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W PET494P07390 489 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W MBA1P38300 278 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W COS8P38723 381 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W LSM1P47017 172 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W FSH2Q05015 223 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W PAM18Q07914 168 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W PEX27Q08580 376 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W YPL199CQ08954 240 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W QDR3P38227 689 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W IRC24P40580 263 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W YGR210CP42942 411 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W AGX1P43567 385 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W HAM1P47119 197 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W CPR4P25334 318 aa6.24□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W YCP4P25349 247 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W YHR122WP38829 231 aa6.24□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W AIM20P40451 204 aa6.24□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W AIM25P47140 327 aa6.24□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W CAX4P53223 239 aa6.24□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W RTT103Q05543 409 aa6.24□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W SYM1Q06563 197 aa6.24□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W POP8P38208 133 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W IMD2P38697 523 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W DOG2P38773 246 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W DOG1P38774 246 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data6.23□□□□□ -1.41not detected
YMR007WYMR007W HPA3P39979 161 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W MIT1P40002 666 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W BUL1P48524 976 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W ALG13P53178 202 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W THI74Q04083 370 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W YGL258W-AQ3E740 77 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W ARP3P47117 449 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W ARO8P53090 500 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W YAP1802P53309 568 aa6.22□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W STP4Q07351 490 aa6.22□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W YOR385WQ08909 290 aa6.22□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YMR007WYMR007W SOD1P00445 154 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
YMR007WYMR007W SRL3P36167 246 aa6.21□□□□□ -1.42
YMR007WYMR007W YER137CP40083 148 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
YMR007WYMR007W IRC18P47056 224 aa6.21□□□□□ -1.42
YMR007WYMR007W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
YMR007WYMR007W SCM3Q12334 223 aa6.21□□□□□ -1.42
YMR007WYMR007W CAP2P13517 287 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.5 ms