RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	SPO13	P23624	291 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	PTM1	P32857	523 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	OM14	P38325	134 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	TRR2	P38816	342 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	TEM1	P38987	245 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	PBA1	Q05778	276 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	SRL1	Q08673	210 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YHR139C-A	O13536	103 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YCR043C	P25361	127 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	PEX34	P25584	144 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	SMP1	P38128	452 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YEA4	P40004	342 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	APQ12	P40532	138 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YIL012W	P40551	113 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	RPE1	P46969	238 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	MNN5	P46982	586 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	RMI1	Q02685	241 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	TVP15	Q03860	143 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YOL160W	Q08321	113 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	NDD1	Q08887	554 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YBR063C	P38083	404 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	FMP23	P38231	175 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	TIM17	P39515	158 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YIL054W	P40524	105 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	SNM1	P40993	198 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	SYS1	P41544	203 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	MEP2	P41948	499 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	CCC1	P47818	322 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	TIM8	P57744	87 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	UBC7	Q02159	165 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	FRQ1	Q06389	190 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	PPT2	Q12036	173 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	YDL180W	Q12301	547 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	ATG5	Q12380	294 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS1B	YML063W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	TKL2	P33315	681 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YBL059W	P34224	193 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	IRC22	P40006	225 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	SNX4	P47057	423 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	TDA4	P47153	279 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YGL088W	P53151	121 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	HHT1	P61830	136 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	INP1	Q03694	420 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	SDH7	Q04401	133 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YDR115W	Q04598	105 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YMR320W	Q04897	101 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	MRX8	Q05473	314 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	HRD1	Q08109	551 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	TIM22	Q12328	207 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	DLS1	P40366	167 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	RPA43	P46669	326 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YJL028W	P47062	111 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	SDT1	P53078	280 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	LPP1	Q04396	274 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	API2	Q04413	109 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YPR202W	Q08993	238 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	IRA2	P19158	3079 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	UBR1	P19812	1950 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	TEL1	P38110	2787 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	DSF1	P0CX08	502 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	YNR073C	P0CX09	502 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	STP22	P25604	385 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	SEC17	P32602	292 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	POP4	P38336	279 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	RFC2	P40348	353 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS1B	YML063W	IGD1	P43598	195 aa		3.44	□□□□□ -1.86

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