RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W NRG1Q03125 231 aa6.83□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W VBA1Q04301 562 aa6.83□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W ATG39Q06159 398 aa6.83□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W AGC1Q12482 902 aa6.83□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W FMT1P32785 401 aa6.82□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W SNU13P39990 126 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W MIC26P50087 233 aa6.82□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W MEH1Q02205 184 aa6.82□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W CAP2P13517 287 aa6.81□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W YBR184WP38299 523 aa6.81□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W CAT5P41735 233 aa6.81□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W TDA4P47153 279 aa6.81□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W KEI1Q06346 221 aa6.81□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W AIM20P40451 204 aa6.8□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W ARP3P47117 449 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W CYC3P06182 269 aa6.79□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W MIR1P23641 311 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W HOM6P31116 359 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W FYV6P53913 173 aa6.79□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W ECM25P32525 599 aa6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W VMA8P32610 256 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W DOG2P38773 246 aa6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W DOG1P38774 246 aa6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W RCF1Q03713 159 aa6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W GRX3Q03835 250 aa6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W FMP42Q04991 504 aa6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W RXT3Q07458 294 aa6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W YNG1Q08465 219 aa6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W ATG5Q12380 294 aa6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W YBR255C-AQ3E776 120 aa6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W PET20Q99373 253 aa6.78□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W GAT4P40569 121 aa6.77□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W IRC24P40580 263 aa6.77□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W GOS1P38736 223 aa6.76□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W IRC18P47056 224 aa6.76□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W ARO8P53090 500 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W YOR352WQ08816 343 aa6.76□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W RAD28Q12021 506 aa6.76□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W PRM4Q12498 284 aa6.76□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W SUS1Q6WNK7 96 aa6.76□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W CDS1P38221 457 aa6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W COS8P38723 381 aa6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W LSM12P38828 187 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W YHR122WP38829 231 aa6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W POR2P40478 281 aa6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W OCA2P53949 197 aa6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W DYN2Q02647 92 aa6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W SYM1Q06563 197 aa6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W MCM21Q06675 368 aa6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W TIM18Q08749 192 aa6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W SCP1Q08873 200 aa6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W FEX1Q08913 375 aa6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W FEX2Q08991 375 aa6.75□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W GPM1P00950 247 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W MRPL33P20084 86 aa6.74□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W RRT1P38192 103 aa6.74□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W POP8P38208 133 aa6.74□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W THI74Q04083 370 aa6.74□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W RTT103Q05543 409 aa6.74□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W ATG31Q12421 196 aa6.74□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W YGL258W-AQ3E740 77 aa6.74□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W GPX2P38143 162 aa6.73□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W CAF16P43569 289 aa6.73□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W HAL1Q01766 294 aa6.73□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W PEX27Q08580 376 aa6.73□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W YOR011W-AQ3E807 68 aa6.73□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W SIP1P32578 815 aa6.72□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W YGR025WP53216 100 aa6.72□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W MSO1P53604 210 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W EST3Q03096 181 aa6.72□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
YLR349WYLR349W URA5P13298 226 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W YBL071CP38185 102 aa6.7□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W CPR8P53728 308 aa6.7□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W MGR3Q04472 501 aa6.7□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W PRE9P23638 258 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W GIM3P53900 129 aa6.69□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W PAM18Q07914 168 aa6.69□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W PRM7Q12459 698 aa6.69□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W SEC66P33754 206 aa6.68□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W UPS2P35200 230 aa6.68□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W NSA2P40078 261 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W YGR050CP53231 118 aa6.68□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W STP4Q07351 490 aa6.68□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W CPR4P25334 318 aa6.67□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W POP5P28005 173 aa6.67□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W WSS1P38838 269 aa6.67□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data6.67□□□□□ -1.34not detected
YLR349WYLR349W SNF11P38956 169 aa6.67□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W HPA3P39979 161 aa6.67□□□□□ -1.34
YLR349WYLR349W MIT1P40002 666 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 73.4 ms