RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	ATP7	P30902	174 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RFC2	P40348	353 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	OKP1	P53298	406 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	CAB4	P53332	305 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	HOT1	Q03213	719 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SMP3	Q04174	516 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	LIP2	Q06005	328 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	LCL2	Q08045	131 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PRM3	Q08931	133 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YMR31	P19955	123 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PHO80	P20052	293 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	FUN26	P31381	517 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	OCH1	P31755	480 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	UMP1	P38293	148 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RRG9	P40156	214 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SSN8	P47821	323 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YIP1	P53039	248 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YGL204C	P53089	101 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YGR042W	P53227	271 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SPC2	Q04969	178 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	FSH2	Q05015	223 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YLR345W	Q06137	509 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	BCP1	Q06338	283 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	LOT6	Q07923	191 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RAD28	Q12021	506 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YPR1	Q12458	312 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PRM7	Q12459	698 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ARO7	P32178	256 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ATG18	P43601	500 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	DSL1	P53847	754 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RCF1	Q03713	159 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	FIT1	Q04433	528 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ATG40	Q99325	256 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	AFG1	P32317	509 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	HYM1	P32464	399 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SHE1	P38200	338 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SLM4	P38247	162 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MIG3	P39943	394 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TIM18	Q08749	192 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	BOL1	Q3E793	110 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RRT15	Q3E811	62 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ODC2	Q99297	307 aa		0.86	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	IFM1	P25038	676 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	OAC1	P32332	324 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	COS8	P38723	381 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YHK8	P38776	514 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MIC26	P50087	233 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ORM1	P53224	222 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	GAL83	Q04739	417 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YPS3	Q12303	508 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TFC7	Q12415	435 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YOL085C	Q99345	113 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ANB1	P19211	157 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TFC1	P32367	649 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YAR068W	P39564	161 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MRX5	P47007	382 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	LCB3	P47013	409 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SRL4	Q03085	281 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MAK3	Q03503	176 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YMD8	Q03697	442 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YLR042C	Q07990	161 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	FEX2	Q08991	375 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		0.85	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TPK3	P05986	398 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PET18	P25362	215 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ERG2	P32352	222 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	FPR2	P32472	135 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PPQ1	P32945	549 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MED8	P38304	223 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	GEP4	P38812	185 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	DFG10	P40526	253 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	BXI1	P48558	297 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YNL095C	P53932	642 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	CAB5	Q03941	241 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RRG8	Q06109	277 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	NEJ1	Q06148	342 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ATG39	Q06159	398 aa		0.84	□□□□□ -2.27

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