RNA–Protein interactions for RNA: YHL028W

WSC4, Transcript of Endoplasmic reticulum (ER) membrane protein, yeast

Gene WSC4, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSC4	YHL028W	IRC22	P40006	225 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	ATG27	P46989	271 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	PAU10	Q03050	120 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	PAU20	Q08322	120 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	LAS17	Q12446	633 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	PAU9	Q3E770	120 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	ATP5	P09457	212 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	MSI1	P13712	422 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	VMA3	P25515	160 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	MRPS5	P33759	307 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	MCH2	P36032	473 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	PAC2	P39937	518 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	YNR040W	P53736	256 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	YAP6	Q03935	383 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	PRR2	Q12310	699 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		6.66	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	SAG1	P20840	650 aa		6.65	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	AFR1	P33304	620 aa		6.65	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	POP2	P39008	433 aa		6.65	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	YDR286C	Q05530	114 aa		6.65	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	FRE8	Q12209	686 aa		6.65	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	ERV2	Q12284	196 aa		6.65	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	YDL180W	Q12301	547 aa		6.65	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
WSC4	YHL028W	SPS4	P09937	338 aa		6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	AHT1	P29589	182 aa		6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	PIN3	Q06449	215 aa		6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RFU1	Q08003	200 aa		6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	SPO13	P23624	291 aa		6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	GAT2	P40209	560 aa		6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	SAE3	P89114	91 aa		6.64	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	STE4	P18851	423 aa		6.63	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	COQ3	P27680	312 aa		6.63	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	UME6	P39001	836 aa		6.63	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	UIP3	P39547	235 aa		6.63	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	GLC8	P41818	229 aa		6.63	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	HNT2	P49775	206 aa		6.63	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	SWT1	Q12104	458 aa		6.63	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	POM33	Q12164	279 aa		6.63	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	IMP1	P28627	190 aa		6.62	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	STD1	Q02794	444 aa		6.62	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YPL077C	Q02831	240 aa		6.62	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	PIN2	Q12057	282 aa		6.62	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	IRA2	P19158	3079 aa		6.61	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	MRPL39	P36533	70 aa		6.61	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YER084W	P40057	128 aa		6.61	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YIL029C	P40538	142 aa		6.61	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	LST7	P53237	242 aa		6.61	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	STP4	Q07351	490 aa		6.61	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	ERV1	P27882	189 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	APS2	Q00381	147 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RCE1	Q03530	315 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YFH1	Q07540	174 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	FIT3	Q08907	204 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RNH203	Q12338	110 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	ATG40	Q99325	256 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YKL075C	P36083	450 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	PDR17	P53844	350 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	MRPL19	P53875	158 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RIM9	Q04734	239 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YPL264C	Q08980	353 aa		6.6	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	PCL7	P40186	285 aa		6.59	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	XPT1	P47165	209 aa		6.59	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	DAD3	P69850	94 aa		6.59	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YDR114C	Q04597	100 aa		6.59	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YMR254C	Q04838	102 aa		6.59	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	RAF1	Q06891	181 aa		6.59	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	YOL029C	Q08187	201 aa		6.59	□□□□□ -1.35
WSC4	YHL028W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36

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