RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W YGL258W-AQ3E740 77 aa6.81□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W MRS3P10566 314 aa6.8□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W LAG1P38703 411 aa6.8□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W CPR8P53728 308 aa6.8□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W TY1A-MR1Q04215 440 aa6.8□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W ATG39Q06159 398 aa6.8□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W YPR013CQ12145 317 aa6.8□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W CYC3P06182 269 aa6.79□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W CPR4P25334 318 aa6.79□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W MLF3P32047 452 aa6.79□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W TDA4P47153 279 aa6.79□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W ARO8P53090 500 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W FYV6P53913 173 aa6.79□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W COX12Q01519 83 aa6.79□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W NRG1Q03125 231 aa6.79□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W THI74Q04083 370 aa6.79□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W MGR3Q04472 501 aa6.79□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W RTT103Q05543 409 aa6.79□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W MSH5Q12175 901 aa6.79□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W CAP2P13517 287 aa6.78□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W POP8P38208 133 aa6.78□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W DFG10P40526 253 aa6.78□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W LSM1P47017 172 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W PAM18Q07914 168 aa6.78□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W PEX27Q08580 376 aa6.78□□□□□ -1.32
CPD1YGR247W CDS1P38221 457 aa6.77□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W MBA1P38300 278 aa6.77□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W COS8P38723 381 aa6.77□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W YHR122WP38829 231 aa6.77□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W MIT1P40002 666 aa6.77□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W SIM1P40472 476 aa6.77□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W YOR385WQ08909 290 aa6.77□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W RRT1P38192 103 aa6.76□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W JLP2P40206 208 aa6.76□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W POR2P40478 281 aa6.76□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W YBR255C-AQ3E776 120 aa6.76□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W HPA3P39979 161 aa6.75□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W CAF16P43569 289 aa6.75□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W IRC18P47056 224 aa6.75□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W EST3Q03096 181 aa6.75□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W RXT3Q07458 294 aa6.75□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W TIM18Q08749 192 aa6.75□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W FEX1Q08913 375 aa6.75□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W FEX2Q08991 375 aa6.75□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W ATG5Q12380 294 aa6.75□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data6.74□□□□□ -1.33not detected
CPD1YGR247W MST28P39552 234 aa6.74□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W IES5P40060 125 aa6.74□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W MIC26P50087 233 aa6.74□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W MST27P53176 234 aa6.74□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W YOR352WQ08816 343 aa6.74□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W AGC1Q12482 902 aa6.74□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W AIM25P47140 327 aa6.73□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W OCA2P53949 197 aa6.73□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W MCM21Q06675 368 aa6.73□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W YBL071CP38185 102 aa6.72□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W ERV15P38312 142 aa6.72□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W YAP1802P53309 568 aa6.72□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W DYN2Q02647 92 aa6.72□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W SPO19Q03029 223 aa6.72□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W FMP42Q04991 504 aa6.72□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W PRM4Q12498 284 aa6.72□□□□□ -1.33
CPD1YGR247W QCR2P07257 368 aa6.71□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W SNU13P39990 126 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W NSA2P40078 261 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W YGR050CP53231 118 aa6.71□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W MSO1P53604 210 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W URA5P13298 226 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W PUP1P25043 261 aa6.7□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W SNF11P38956 169 aa6.7□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data6.7□□□□□ -1.34not detected
CPD1YGR247W LDS2Q08218 356 aa6.7□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W PRE9P23638 258 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W YPS3Q12303 508 aa6.69□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W POP5P28005 173 aa6.68□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W MRP17P28778 131 aa6.68□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W UPS2P35200 230 aa6.68□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W RTS2P40962 232 aa6.68□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W SER2P42941 309 aa6.68□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W AVT5P38176 459 aa6.67□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W WSS1P38838 269 aa6.67□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W STP4Q07351 490 aa6.67□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W YOR011W-AQ3E807 68 aa6.67□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W BOL3P39724 118 aa6.66□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W YGR018CP53211 109 aa6.66□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W DCS1Q06151 350 aa6.66□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W FRQ1Q06389 190 aa6.66□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W IZH3Q07959 543 aa6.66□□□□□ -1.34
CPD1YGR247W YCT1Q12235 531 aa6.66□□□□□ -1.34
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