RNA–Protein interactions for RNA: YEL038W

UTR4, Transcript of Protein with sequence similarity to acireductone synthases, yeast

Gene UTR4, Length 684 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTR4	YEL038W	HMX1	P32339	317 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YBR144C	P34215	104 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YKL102C	P34249	101 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	SDH8	P38345	138 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YJR012C	P47087	207 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	DUG3	P53871	357 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YML108W	Q03759	105 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	CAC2	Q04199	468 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	FIT1	Q04433	528 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	MSA1	Q08471	629 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	VPS63	O13549	108 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	ZRC1	P20107	442 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	MRS4	P23500	304 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YOX1	P34161	385 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YBR220C	P38318	560 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	SNN1	P48232	102 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	ODC1	Q03028	310 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	RIM9	Q04734	239 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	TDA6	Q06466	467 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	FCY22	Q12119	530 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	COQ2	P32378	372 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	ECM25	P32525	599 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	SRB6	P32570	121 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	SIP1	P32578	815 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	ECM31	P38122	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	SLM6	P38343	150 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YHL044W	P38727	235 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	UIP3	P39547	235 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	RMD6	P39975	231 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YEA4	P40004	342 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YER188W	P40103	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	RFC2	P40348	353 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	SLM1	P40485	686 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	EMC5	P40540	141 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	GON7	P46984	123 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	CRZ1	P53968	678 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	HSK3	P69852	69 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	ATC1	Q04005	294 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	LIP2	Q06005	328 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	PAM18	Q07914	168 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	GAT3	Q07928	141 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	DGK1	Q12382	290 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	LDS1	P31379	325 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YKL162C	P36052	402 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	MCM22	P47167	239 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	APJ1	P53940	528 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	DCS1	Q06151	350 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	IZH3	Q07959	543 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	COA2	Q3E823	68 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	CNB1	P25296	175 aa		4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	MSK1	P32048	576 aa		4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	SHG1	P38337	142 aa		4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	IKI1	P38874	309 aa		4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	VHS2	P40463	436 aa		4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	XPT1	P47165	209 aa		4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	CGR1	P53188	120 aa		4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	HRD1	Q08109	551 aa		4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	RFM1	Q12192	310 aa		4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	ATG5	Q12380	294 aa		4.34	□□□□□ -1.71
UTR4	YEL038W	RPL39	P04650	51 aa		4.33	□□□□□ -1.72
UTR4	YEL038W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
UTR4	YEL038W	LSB5	P25369	354 aa		4.33	□□□□□ -1.72
UTR4	YEL038W	CPR5	P35176	225 aa		4.33	□□□□□ -1.72
UTR4	YEL038W	SPC25	P40014	221 aa		4.33	□□□□□ -1.72
UTR4	YEL038W	YJR056C	P47115	236 aa		4.33	□□□□□ -1.72
UTR4	YEL038W	SBH2	P52871	88 aa		4.33	□□□□□ -1.72
UTR4	YEL038W	YNR066C	P53752	436 aa		4.33	□□□□□ -1.72
UTR4	YEL038W	WSC2	P53832	503 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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